贷款逾期还本金一般不能直接开具发票，但需根据具体情况分析，以下分情况详细说明：

1. 贷款本金性质与发票开具规则
   根据《发票管理办法》及增值税相关规定，发票的开具需以“销售商品、提供服务或从事其他经营活动”为前提。贷款本金本质是金融机构（如银行）向借款人提供的资金使用权，属于金融业务范畴，而非商品或服务交易。因此，贷款本金本身不属于增值税应税项目，金融机构通常不会就本金部分开具发票。

2. 逾期还款的特殊情形
   若贷款逾期后，金融机构与借款人协商以“还本金”形式结清债务（例如减免利息、违约金后仅收回本金），此时需区分两种情况：

   • 若本金未产生额外费用：金融机构仅收回本金，仍无需开具发票，但可能出具《贷款结清证明》或《还款确认书》作为债权消灭的凭证。
     
   • 若本金涉及违约金或罚息：若逾期还款中包含违约金、罚息等费用（即使最终协商减免），金融机构可能需就实际收取的违约金部分开具增值税发票（按“金融服务-贷款服务”税率6%计税），但本金部分仍不涉及发票。

3. 实务操作建议

   • 借款人角度：若需证明还款事实，可要求金融机构出具书面结清证明或还款凭证，而非发票。若金融机构拒绝开具且涉及纠纷，可依据《民法典》第676条（借款人逾期还款责任）主张权利。
     
   • 金融机构角度：应完善内部流程，在贷款结清时主动提供结清证明，避免因凭证缺失引发争议。若收取违约金或罚息，需依法申报纳税并开具发票。

总结：贷款逾期还本金通常不涉及发票开具，但需根据是否包含应税费用（如违约金）区分处理。若您遇到具体纠纷或需进一步分析合同条款，可直接向我咨询，我会结合合同内容、还款记录等细节为您制定解决方案。