结论：员工拿走货款后还要仲裁企业，企业需根据不同情况积极应对，包括核实员工行为性质、准备证据材料、参与仲裁程序等，以维护自身合法权益。
分析说明：
核实员工行为性质：
- 企业首先需要核实员工拿走货款的具体情况，包括货款金额、拿走方式（如是否经过授权、是否利用职务之便）、是否构成违法或犯罪行为等。
- 如果员工的行为涉嫌职务侵占、挪用资金等违法犯罪行为，企业应及时向公安机关报案，并配合调查。
准备证据材料：
- 企业应收集并整理与员工拿走货款相关的所有证据材料，如合同、发票、收据、银行转账记录、员工工作记录、监控录像等。
- 这些证据材料将用于证明员工的行为是否违法或违约，以及企业因此遭受的损失。
参与仲裁程序：
- 如果员工向劳动仲裁机构提起仲裁，企业应积极应诉，按照仲裁机构的要求提交答辩状和证据材料。
- 在仲裁过程中，企业可以主张员工的行为违反了劳动合同或公司规章制度，要求员工承担相应的法律责任，如返还货款、赔偿损失等。
- 同时，企业也可以提出反仲裁请求，如果员工的行为给企业造成了其他损失，如声誉损害、客户流失等，企业可以要求员工进行赔偿。
考虑法律后果：
- 如果仲裁机构裁决员工需返还货款或赔偿损失，企业应督促员工履行裁决义务。
- 如果员工不履行裁决义务，企业可以向人民法院申请强制执行。
- 另外，如果员工的行为构成犯罪，企业还应配合司法机关追究员工的刑事责任。
特殊场景：
- 如果员工拿走货款的行为是基于某种误解或错误认为有合法依据，企业应在仲裁过程中积极澄清事实，避免不必要的法律纠纷。
- 如果员工拿走货款的行为与企业的管理漏洞或制度缺陷有关，企业应在处理完当前纠纷后，及时完善相关管理制度，防止类似事件再次发生。
行动建议：
- 及时咨询专业律师：在处理此类纠纷时，企业应及时咨询专业律师，了解相关法律法规和仲裁程序，以便更好地维护自身权益。
- 加强内部管理：企业应加强对员工的管理和监督，完善相关规章制度，明确员工职责和权限，防止员工利用职务之便进行违法或违约行为。
- 保留证据材料：企业应建立完善的证据管理制度，确保与员工行为相关的所有证据材料都能得到妥善保存和整理。
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