合同上写明工资3500元，但实际到手工资却不一样，这种情况可能由多种因素导致。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 扣除项目：

   • 社保与公积金：根据《中华人民共和国社会保险法》和《住房公积金管理条例》，用人单位和劳动者需按一定比例缴纳社会保险费和住房公积金。这些费用通常从工资中扣除，因此实际到手工资会少于合同约定的金额。
   • 个人所得税：根据《中华人民共和国个人所得税法》，劳动者的工资收入达到一定标准时，需缴纳个人所得税。税额根据工资收入和税率计算，也会从工资中扣除。
   • 其他扣除：如迟到、早退、旷工等违反公司规章制度的行为，公司可能根据内部规定扣除相应工资；或者劳动者因个人原因（如借款、赔偿等）需从工资中扣除款项。

2. 工资构成：

   • 基本工资与绩效工资：合同上写的3500元可能是基本工资，而实际发放时可能还包括绩效工资、奖金等。如果绩效不达标或未发放奖金，实际到手工资可能会少于3500元。
   • 加班工资：如果劳动者在合同约定的工作时间外加班，根据《中华人民共和国劳动法》，用人单位应支付加班工资。但加班工资可能并不包含在合同约定的3500元内，而是额外发放。因此，如果劳动者有加班情况，实际到手工资可能会多于3500元（但也可能因其他扣除项目而少于3500元）。

3. 合同变更或补充协议：

   • 合同变更：如果用人单位与劳动者在合同履行过程中协商一致变更了工资条款，且未以书面形式明确记录，可能导致实际发放工资与合同约定不符。
   • 补充协议：双方可能签订了补充协议，对工资发放方式、时间、金额等进行了另行约定。如果劳动者未仔细阅读或理解补充协议内容，也可能导致对实际到手工资的误解。

4. 用人单位违法行为：

   • 未足额支付工资：如果用人单位存在故意或过失未足额支付工资的行为，如克扣工资、无故拖欠工资等，劳动者有权要求用人单位补足差额，并可能依据《中华人民共和国劳动合同法》等法律法规追究用人单位的法律责任。

针对您的情况，建议您采取以下措施：

• 核对工资条：仔细核对工资条上的各项扣除项目和金额，确保用人单位按照法律法规和合同约定进行扣除。
• 咨询用人单位：如果对工资条上的扣除项目或金额有疑问，及时向用人单位的人力资源部门或财务部门咨询，了解具体情况。
• 保留证据：保留好合同、工资条、银行流水等证据材料，以备不时之需。
• 寻求法律帮助：如果认为用人单位存在违法行为或未足额支付工资的情况，可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律帮助，维护自己的合法权益。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。