关于在公司二次入职时工龄如何认定的问题，这确实是一个涉及劳动者权益的重要方面。下面我将结合相关法律法规和实际案例，为您详细解答。
一、工龄的基本分类
工龄一般分为一般工龄和连续工龄。一般工龄是指工人职员以工资收入为生活资料之全部或主要来源的工作时间，计算时包括本企业工龄在内。而连续工龄则是指职工以工资收入为全部或主要生活资料来源的连续或可以合并计算的工作年限，它更侧重于工作的连续性和稳定性。
二、二次入职时工龄的认定原则
非因劳动者原因导致的二次入职：
- 如果劳动者是因为用人单位的原因（如组织调动、公司合并、分立等）而二次入职，那么其工龄应当连续计算。这意味着，劳动者在原用人单位的工作年限应当合并计算到新用人单位的工作年限中。
- 例如，在案例中，刘某虽然提交了辞职申请，但实际上并未中断工作，且A公司也持续为其申报个税和缴纳社保。因此，法院认定刘某的劳动关系处于连续状态，工龄应连续计算。
因劳动者自身原因导致的二次入职：
- 如果劳动者是因为自身原因（如个人职业规划、家庭原因等）而主动辞职，并在间隔一段时间后重新入职同一用人单位，那么其工龄通常不会连续计算。新用人单位可以只计算劳动者重新入职后的工作年限。
三、工龄认定的具体依据
在认定工龄时，用人单位和劳动者可以依据以下材料来确定职工的工作年限：
- 档案记载：包括职工的个人档案、工作记录等，这些材料可以反映职工的工作经历和工作时间。
- 单位缴纳社会保险费记录：社会保险费记录是证明职工工作年限的重要依据之一，它可以反映职工在用人单位的缴费情况和工作时间。
- 劳动合同：劳动合同是证明职工与用人单位之间劳动关系的重要法律文件，它可以明确职工的工作岗位、工作时间等关键信息。
- 其他具有法律效力的证明材料：如工作证、工资单、考勤记录等，这些材料也可以作为认定工龄的辅助依据。
四、特殊情况下的工龄认定
- 用人单位迫使劳动者辞职后重新签订劳动合同：如果用人单位通过迫使劳动者辞职后重新签订劳动合同的方式，试图“斩断”劳动者的工龄，那么这种行为是违法的。劳动者的工龄应当连续计算，不受这种行为的影响。
- 关联企业之间的工龄认定：如果劳动者在用人单位的关联企业之间流动工作，且这种流动并非因劳动者自身原因导致，那么其工龄也应当连续计算。
五、建议与提示
- 劳动者应保存好相关证据：如劳动合同、工作记录、社保缴费记录等，以便在需要时证明自己的工作年限和工龄。
- 用人单位应遵守法律法规：在认定工龄时，用人单位应遵守相关法律法规的规定，不得通过不正当手段“斩断”劳动者的工龄或损害劳动者的合法权益。
综上所述，二次入职时工龄的认定需要根据具体情况来判断。如果是因为非劳动者原因导致的二次入职，工龄应当连续计算；如果是因为劳动者自身原因导致的二次入职，工龄则通常不会连续计算。在认定工龄时，双方可以依据档案记载、社保缴费记录、劳动合同等材料来确定职工的工作年限。希望这些解答能对您有所帮助。