结论：仅从您描述的情况来看，公司一般不违法，但具体是否违法还需结合实际情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
合同效力角度
- 合同未盖公章的效力
- 一般来说，合同自双方当事人签字或者盖章时成立。如果试用期签订的合同，公司一方尚未盖公章，但公司已经以其他方式表明接受合同内容，比如公司相关负责人已经签字，或者公司已经开始按照合同约定履行主要义务（如安排您工作、支付部分工资等），那么该合同仍然可能被认定为成立并生效。在这种情况下，您与公司协商离职，是双方对合同履行的一种变更或解除，公司通常不违法。
- 若公司既未签字也未盖章，且没有以任何实际行为表明接受合同内容，那么这份合同可能尚未成立。此时您与公司协商离职，由于合同未成立，也就不存在公司违法的问题。不过，如果公司存在故意拖延盖章等不诚信行为，可能涉及其他法律问题，但这与您此次咨询的离职是否违法关联性不大。
- 协商离职的合法性
- 无论是合同成立与否，只要您与公司是在平等、自愿的基础上进行协商，并且达成了一致意见，那么这种协商离职的行为是合法有效的。双方可以就离职的相关事宜，如工资结算、工作交接等进行约定，一旦达成协议，双方都应当按照约定履行。
试用期相关规定角度
- 试用期的约定
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》规定，劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。如果公司约定的试用期超过了法定标准，那么公司存在违法行为。不过，这与您在试用期内协商离职本身并无直接关联，但可能会影响您在离职时的一些权益，比如经济补偿等。
- 试用期离职的权利
- 在试用期内，劳动者提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。这是法律赋予劳动者在试用期内的特殊权利。如果您是按照法律规定提前三日通知公司后协商离职的，那么您的行为完全合法，公司也不存在违法阻止您离职的情况。
特殊情况分析
- 公司存在欺诈、胁迫等行为
- 如果公司在签订合同过程中存在欺诈、胁迫等行为，导致您在违背真实意思的情况下签订合同，然后又与您协商离职，那么公司的行为可能违法。例如，公司以虚假的工作条件、薪资待遇等诱使您签订合同，之后又以各种理由要求您离职，这种情况下您可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 公司未支付劳动报酬等
- 如果在试用期内，公司未按照合同约定或者法律规定支付您劳动报酬、提供劳动保护和劳动条件等，您有权解除劳动合同。此时即使您与公司协商离职，如果公司存在上述违法行为，您可以通过法律途径要求公司支付拖欠的工资、经济补偿等。
建议：
- 如果您对公司的行为存在疑虑，或者认为公司在试用期内存在违法行为，您可以先与公司进行沟通协商，要求公司说明情况并解决您的问题。
- 如果沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门会对公司的违法行为进行调查处理。
- 您也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，您需要提供相关的证据，如劳动合同、工资支付记录、工作证明等，以证明您的主张。
如果您还有其他关于劳动工伤或合同纠纷方面的问题，欢迎随时向我咨询。