有商铺的住宅楼是否可以合法经营，需分情况讨论，主要取决于该住宅楼的规划用途、当地政策以及是否满足相关条件。以下从不同角度为您详细分析：

1. 规划用途与产权性质

• 若住宅楼规划用途明确包含商业功能（如商住两用楼），且产权证上注明可经营，则通常可以合法经营商铺。但需注意，即使规划允许，仍需遵守当地对商业经营的具体规定（如营业时间、噪音控制等）。
• 若住宅楼规划用途仅为居住，则原则上不得擅自改变用途用于经营。根据《民法典》第二百七十九条，业主不得违反法律、法规以及管理规约，将住宅改变为经营性用房。若需改变，需经有利害关系的业主一致同意，并依法办理相关手续。

2. 当地政策与行政许可

• 经营许可：即使规划允许，经营商铺仍需办理工商营业执照、税务登记等手续。部分行业（如餐饮、娱乐）还需额外取得卫生许可、消防许可等。
• 政策限制：部分城市出于城市规划、交通管理或居民生活品质考虑，可能对住宅楼内经营商铺作出限制（如禁止开设餐饮、娱乐场所）。需提前咨询当地城管、工商等部门，确认是否允许经营及具体要求。

3. 利害关系业主的同意

• 若住宅楼规划用途为居住，但业主希望将部分房屋改为商铺，需满足《民法典》第二百七十九条的要求：经有利害关系的业主一致同意。有利害关系的业主通常指同一楼栋或相邻楼栋的业主，他们可能因经营行为（如噪音、人流）受到影响。
• 实践中，可通过书面征求意见、召开业主大会等方式取得同意，并保留相关证据（如签字文件、会议记录），以备后续争议时使用。

4. 法律后果与风险提示

• 合法经营：若满足规划用途、政策要求及利害关系业主同意，经营商铺是合法的，可正常开展业务。
• 违法经营：若擅自改变住宅用途且未取得相关许可，可能面临行政处罚（如罚款、责令停业），甚至被邻居起诉要求恢复原状、赔偿损失。

5. 建议与操作步骤

• 步骤一：查看产权证及规划图纸，确认房屋是否允许商业经营。
• 步骤二：咨询当地工商、城管部门，了解经营行业是否受限及所需许可。
• 步骤三：若需改变住宅用途，书面征求利害关系业主同意，并保留证据。
• 步骤四：依法办理工商、税务等登记手续，确保合规经营。

总结：有商铺的住宅楼能否合法经营，需结合规划用途、当地政策及利害关系业主意见综合判断。若您有具体案例或进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。