关于厂里吸烟罚款是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要综合考虑多个因素，包括工厂的规章制度、劳动合同的约定、罚款的合理性以及相关法律法规的遵循情况。
首先，从法律层面来看：
工厂无直接行政处罚权：根据《中华人民共和国行政处罚法》，行政处罚只能由具有行政处罚权的行政机关实施。工厂作为非行政机关，并不具备直接的行政处罚权，因此从严格的法律意义上讲，工厂直接对员工处以罚款（作为行政处罚）是不合法的。
规章制度与劳动合同的约定：然而，工厂可以通过制定合法有效的规章制度，并在劳动合同中与员工进行明确约定，来规范员工的行为。如果规章制度中明确规定了禁止在特定区域（如易燃易爆生产车间）吸烟，并规定了相应的处理措施（如扣除绩效奖金等，而非直接罚款），且这些规定经过了合法的制定程序（如经过民主程序制定，内容不违反法律法规），员工也知晓并同意了这些规定，那么当员工违反规定吸烟时，工厂可以依据规章制度采取合理处理措施。
其次，从罚款的合理性来看：
即使工厂有合法有效的规章制度作为支撑，罚款的金额也必须合理。过高的罚款金额可能构成对员工权益的侵害，是不合法的。工厂在设定罚款金额时，应充分考虑吸烟行为的性质、可能造成的影响以及员工的经济承受能力等因素。
再者，从工作环境安全与健康的角度来看：
工厂有责任提供安全健康的工作环境，并采取必要措施保护员工免受危害。吸烟在特定环境下（如易燃易爆生产车间）可能构成严重的安全隐患，因此工厂有权制定并执行关于吸烟等可能危及工作环境安全的规章制度。
具体操作建议：
对于工厂：应确保规章制度的合法性、有效性和透明度。在制定规章制度时，应遵循民主程序，确保内容不违反法律法规；在执行规章制度时，应确保员工知晓并同意相关规定，并避免直接以罚款作为管理手段，而是采取更为合理和合法的处理措施。
对于员工：应了解并遵守工厂的规章制度。如果认为工厂的规章制度不合法或不合理，或者认为自己的权益受到了侵害，可以向劳动部门投诉或寻求专业法律人士的帮助。
举例说明：
假设某化工工厂制定了安全生产规章制度，明确规定在生产车间等易燃易爆区域禁止吸烟，并经过了职工代表大会讨论通过及全体员工公示。员工小张违规在车间吸烟，工厂根据规章制度扣除了他当月的部分绩效奖金。在此情况下，由于工厂有合法有效的规章制度且员工已知晓并同意，工厂的处理方式通常是合法的。
综上所述，厂里吸烟罚款的合法性并非一概而论，而是需要根据具体情况进行分析和判断。工厂在制定和执行相关规定时应确保合法性和合理性，员工也应遵守相关规定并了解自己的权益。