针对您提出的“国企整合正式员工怎么处理”的问题，这确实是一个涉及多方面权益保障和流程优化的复杂议题。以下是我根据相关政策和实践，为您提供的详细解答：
一、员工经济权益保障
在国企整合过程中，员工的经济权益是首要保障的对象。根据相关政策，国企整合应严格执行职工安置政策，确保员工的经济利益不受损害。
经济补偿金：对于整合后分流到其他企业的员工，其经济补偿金的计发年限应将员工在原企业的工作年限与到新企业后的工作年限合并计算。若员工被分流到非国有法人控股的改制企业，原企业应与其办理解除劳动合同手续，并依法支付经济补偿金。
社会保险费：对于整合过程中可能出现的欠缴社会保险费问题，政府和企业应共同努力，从企业国有产权转让收入、国有土地出让收益等渠道中支付欠缴的社会保险费，确保员工的社保权益不受影响。
退休待遇：对于符合退休条件的员工，即使原企业存在欠费情况，也应按规定办理退休手续，并兑现养老保险待遇。
二、员工民主权益保障
国企整合应坚持公开、公正、公平的原则，确保员工的知情权、参与权和选择权。
职工代表大会审议：整合方案，特别是涉及员工安置的部分，必须经职工代表大会或职工大会审议通过，确保员工的意见得到充分表达。
自主选择权利：员工有权自主选择经济补偿金的支付方式（现金、入股或转为债权），以及劳动合同的期限、内部退养等问题，应由改制企业与员工协商确定。
三、员工就业再就业支持
国企整合可能导致部分员工面临再就业的问题，政府和企业应提供必要的支持和帮助。
援企稳岗政策：政府应加大援企稳岗政策的实施力度，如提供失业保险金返还、阶段性降低失业保险费率和工伤保险费率等，以减轻企业负担，稳定就业岗位。
就业创业服务：针对下岗员工，政府和企业应提供就业创业服务，如开展岗前培训、在岗培训、转岗培训等，提升员工的就业能力。同时，提供职业介绍、职业指导、创业孵化等服务，帮助员工尽快实现再就业。
四、流程优化与政务服务提升
在国企整合过程中，还应注重流程优化和政务服务提升，以减轻员工和企业的负担。
高效办成员工录用“一件事”：借鉴人力资源社会保障部等部门联合印发的实施意见，将就业登记、流动人员人事档案接收、劳动用工备案等多个“单项事”整合为“一件事”，优化业务流程，精简证明材料，缩减办理时限。
拓展办理渠道：通过网上就业平台、公共招聘平台等多种渠道，提供便捷的政务服务，方便员工办理相关手续。
综上所述，国企整合过程中正式员工的处理应综合考虑经济权益保障、民主权益保障、就业再就业支持以及流程优化与政务服务提升等多个方面。政府和企业应共同努力，确保员工的合法权益得到充分保障，同时促进企业的顺利整合和持续发展。