复议机关在审查申请人要求确认以租代征行为违法的案件时，是有权直接确认该行为违法的。以下从多个角度进行分析：

1. 复议机关的职权与职责：

   • 复议机关作为行政机关内部的监督机构，其职责之一就是审查下级行政机关或本级行政机关的具体行政行为是否合法、适当。
   • 在复议过程中，如果复议机关发现被申请的具体行政行为（如以租代征行为）存在违法情形，它有权直接作出确认违法的复议决定。

2. 以租代征行为的法律性质：

   • “以租代征”通常指的是通过租赁土地的方式，实际上却将土地用于非农业建设或改变土地用途，这种行为往往违反了土地管理法律法规的相关规定。
   • 如果复议机关在审查过程中确认了以租代征行为的违法性，那么它就有责任和义务在复议决定中明确指出这一点。

3. 复议决定的法律效力：

   • 复议决定是复议机关对具体行政行为进行审查后作出的具有法律效力的决定。
   • 一旦复议机关在复议决定中确认了以租代征行为的违法性，该决定就对相关当事人产生了法律约束力，被申请的行政机关必须执行。

4. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，复议机关在作出确认违法的复议决定前，通常会进行充分的调查和取证，以确保决定的准确性和公正性。
   • 如果复议机关认为需要进一步了解情况或听取当事人的意见，它可能会举行听证会或要求当事人提供补充材料。

5. 法律后果与救济途径：

   • 如果复议机关确认了以租代征行为的违法性，被申请的行政机关可能需要承担相应的法律责任，如撤销或变更原具体行政行为、赔偿损失等。
   • 同时，相关当事人如果对复议决定不服，还可以依法向人民法院提起行政诉讼，寻求进一步的法律救济。

建议：

• 如果您作为申请人认为某行政机关的以租代征行为违法，并希望复议机关确认这一点，您应当向复议机关提交充分的证据和理由来支持您的主张。
• 在复议过程中，您应当积极配合复议机关的调查和取证工作，以确保复议机关能够全面、准确地了解案件情况。
• 如果您对复议决定不服，您可以在法定期限内向人民法院提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。

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