结论：在只设一名董事的国有企业中，经理层的任免通常不能直接由股东进行，而是需要遵循公司章程及相关法律法规的规定，可能涉及董事会或上级主管部门的决策。

分析说明：

1. 公司治理结构：

   • 国有企业，尤其是只设一名董事的国有企业，其治理结构可能相对简化，但仍需遵循《公司法》及国有企业相关管理规定。
   • 在公司治理中，股东会（或股东大会）是公司的最高权力机构，但具体到经理层的任免，往往不是由股东直接决定，而是由董事会或执行董事（在只设一名董事的情况下）根据职权进行。

2. 经理层的任免程序：

   • 根据《公司法》及相关规定，经理层的任免通常属于董事会的职权范围。在只设一名董事的国有企业中，这名董事可能同时担任执行董事的角色，负责公司的日常经营决策，包括经理层的任免。
   • 然而，国有企业的特殊性在于，其可能还受到上级主管部门或国有资产监督管理机构的监管。因此，经理层的任免可能还需要经过这些机构的批准或备案。

3. 股东的角色与限制：

   • 股东作为公司的出资者，享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利。但在具体到经理层的任免上，股东通常不直接行使这一权力，而是通过选举董事会成员或执行董事来间接影响。
   • 在国有企业中，股东（尤其是国有股东）的角色可能更加复杂，他们可能还需要考虑国有资产的保值增值、社会公共利益等因素。

4. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，只设一名董事的国有企业可能根据其公司章程和内部管理规定来具体确定经理层的任免程序。这些规定可能涉及董事会的决策、上级主管部门的审批、职工代表大会的意见等多个方面。
   • 因此，不能简单地认为股东可以直接任免经理层，而需要综合考虑公司章程、法律法规以及实际操作中的各种因素。

法律建议：

• 对于只设一名董事的国有企业，建议明确公司章程中关于经理层任免的规定，确保符合《公司法》及国有企业相关管理规定。
• 在进行经理层任免时，应遵循公司章程规定的程序，并可能需要获得上级主管部门或国有资产监督管理机构的批准或备案。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律指导，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。