中标供应商将政府采购合同转包并收取管理费的行为，其违法所得的确定需结合具体法律规定与实际情形综合判断，核心在于明确转包行为的违法性及管理费的非法属性。以下从法律定性、违法所得计算方式、实务操作要点三个维度展开分析：

一、法律定性：转包行为本身即违法，管理费属于违法所得

根据《中华人民共和国政府采购法》第四十八条及《中华人民共和国招标投标法》第四十八条，中标供应商不得将合同转包给第三方，除非经采购人书面同意且分包部分符合法定条件（如非主体、非关键性工作）。若未经同意擅自转包，转包行为本身即构成违法，而中标供应商通过转包收取的“管理费”，本质是利用违法转包行为获取的额外利益，属于《行政处罚法》第二十八条规定的“违法所得”，应当依法予以没收。

二、违法所得的计算方式：需区分“实际收入”与“合理成本”

违法所得的认定并非简单以“管理费总额”为准，而是需扣除必要、合理的成本后确定。实务中通常采用以下两种方式：

1. “收入-成本”法：
   违法所得=实际收取的管理费总额-为转包行为支出的必要成本（如合同管理、协调等直接费用）。
   注意：若中标供应商无法证明成本支出的合理性（如未留存发票、合同等证据），或成本明显低于行业惯例，可能被全额认定为违法所得。

2. “全部收入”法：
   若管理费本身无合理成本支撑（如仅以“转包费”名义收取，未提供实际管理服务），或转包行为导致合同履行质量下降、损害公共利益，监管部门可能直接将全部管理费认定为违法所得，不予扣除成本。

三、实务操作要点：证据收集与法律程序

1. 证据收集：

   • 采购人或监管部门需固定转包证据（如转包合同、付款记录、现场照片等）；
     
   • 调查中标供应商是否提供实际管理服务（如人员派驻、技术指导等），若未提供则管理费缺乏合法性基础；
     
   • 核实中标供应商是否将转包情况告知采购人并取得同意，未告知即构成违法。

2. 法律程序：

   • 监管部门（如财政部门、招投标监管机构）需依法启动调查程序，听取中标供应商陈述申辩；
     
   • 若认定违法，需出具《行政处罚决定书》，明确没收违法所得的金额及依据；
     
   • 中标供应商若不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，但需承担举证责任证明管理费的合法性。

总结建议

若您是采购人或监管部门，发现中标供应商存在转包并收取管理费的行为，建议立即固定证据并启动调查程序，重点核查管理费的合理性及转包行为的违法性；若您是中标供应商，需警惕转包行为的法律风险，即使收取管理费也可能因违法被没收，甚至面临罚款、列入不良记录等更严厉处罚。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据材料为您分析违法所得的具体认定逻辑。