针对您提出的企业利用二建证书办理资质后解除持证人合同的问题，这确实是一个涉及持证人权益的重要事项。以下是我为您提供的详细解答和建议：
首先，我建议您与证件使用公司进行友好协商，尝试自行处理这一问题。在协商过程中，您可以明确表达您的诉求和权益，要求公司按照合同约定或相关法律法规，妥善处理您的证书使用及合同解除事宜。
如果协商无果，或者公司存在不配合、违规操作等行为，您可以依据相关法律法规来维护自己的权益。具体来说，根据《住房和城乡建设部办公厅关于做好工程建设领域专业技术人员职业资格“挂证”等违法违规行为专项整治工作的补充通知》（建办市函〔2019〕92号）文件的相关规定，如果注册单位或个人一方反映与另一方不存在聘用关系，而另一方不予配合办理注销或变更手续的，省级住房和城乡建设主管部门可依据一方申请及其提交的解除劳动合同书面证明、劳动仲裁、司法判决等材料，直接办理注销手续。
因此，在准备申请注销或变更手续时，您需要准备以下材料：
申请报告：虽然无固定格式，但应清晰阐述您的诉求、与公司的聘用关系情况以及要求注销或变更证书的原因。
身份证复印件：作为身份验证的必要材料。
解除劳动合同书面证明：如果公司已经出具了解除劳动合同的证明，请务必提供。如果公司未出具，且您认为公司存在违规行为，您可以考虑通过劳动仲裁或司法途径来获取相关证明。
劳动仲裁或司法判决证明（如适用）：如果与公司的纠纷无法通过协商解决，且您已经通过劳动仲裁或司法途径来维护自己的权益，那么请提供相关的仲裁裁决书或判决书作为证明。
准备好上述材料后，您可以将其提交至自治区政务服务中心住建厅窗口（以您所在地区为准，示例中的地址为南宁市怡宾路6号自治区政务服务中心3楼住建厅窗口）办理证件解除业务。同时，您也可以联系收件单位（自治区住房和城乡建设厅）的收件电话（示例中的电话为0771-5595842、5595535）进行咨询和确认。
最后，我建议您在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，依法维护自己的权益。如果遇到复杂或难以解决的问题，您可以考虑咨询专业的法律人士或相关机构来获取更具体的帮助和指导。