针对您面临特殊工种退休但原单位有两年的档案遗失的问题，以下是我为您提供的详细解答和建议：
首先，我理解档案遗失可能给您办理特殊工种退休带来了一定的困扰。但请放心，根据市人社局的相关政策和实践，我们是有办法来解决这个问题的。
一、了解档案补救工作机制
市人社局已经创新了职工档案补救工作机制，旨在提高特殊工种提前退休审批的工作效率。这一机制主要包括两个方面：
与市企事业档案馆等部门建立联席工作机制：
- 人社局会将所需材料清单一次性提交给档案馆。
- 档案馆负责查阅原件并复印后提交给退休审批部门。
- 这样可以让档案信息多跑路，让人民群众少跑腿，方便企业及职工查询档案资料。
与企业建立联系：
- 针对部分改制企业相关档案材料没有完全移交到企事业档案馆，导致职工档案缺失的问题。
- 人社局会主动与企业或清算小组联系，调取工资表、考勤表、营养费补贴表等材料。
- 这些材料可以作为佐证，最大程度还原职工的工作经历。
二、您应该采取的行动
联系当地人社局：
- 首先，您需要联系当地的人社局，特别是养老保险处或相关负责特殊工种退休审批的部门。
- 向他们说明您的情况，即原单位有两年的档案遗失，但您需要办理特殊工种退休。
提供现有材料：
- 尽可能提供您手中现有的与特殊工种工作相关的材料，如工作证、工资单、考勤记录等。
- 这些材料虽然可能不完全，但可以作为您工作经历的初步证明。
配合人社局的调查取证：
- 人社局可能会根据您的情况，启动档案补救工作机制。
- 他们可能会要求您提供一些额外的信息或材料，或者安排人员对您的工作经历进行调查取证。
- 请您积极配合他们的工作，提供必要的协助和信息。
等待审批结果：
- 在人社局完成调查取证和档案补救工作后，他们会根据客观事实进行特殊工种提前退休审批。
- 请您耐心等待审批结果，并保持与人社局的沟通联系，及时了解审批进展。
三、注意事项
- 在整个过程中，请保持与人社局的良好沟通，及时提供他们需要的材料和信息。
- 如果您对审批结果有异议或疑问，可以向人社局提出申诉或咨询，他们会为您提供进一步的解答和帮助。
最后，我相信在市人社局的档案补救工作机制下，您能够顺利解决档案遗失的问题，并成功办理特殊工种退休手续。希望这些建议能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。