结论：即使合同中仅约定不得侵权而未约定赔偿金额，在侵权行为发生时，您仍然有权申请赔偿。赔偿金额的确定将依据实际损失、侵权人获利情况或法定赔偿标准等因素综合考量。

详细分析：

1. 合同中的侵权条款效力：

   • 合同中明确约定不得侵权的条款，是双方真实意思的表示，具有法律约束力。一旦一方违反该条款，即构成违约，同时也可能构成侵权（如侵犯知识产权、商业秘密等）。
   • 即便合同未明确约定赔偿金额，这并不影响违约或侵权责任的成立。赔偿金额的确定是后续法律程序中的问题，而非合同效力或责任成立的前提。

2. 赔偿金额的确定原则：

   • 实际损失原则：根据《民法典》等相关法律规定，侵权人应当赔偿因其侵权行为给被侵权人造成的实际损失。这包括直接损失和间接损失，如因侵权导致的销售额减少、客户流失等。
   • 侵权人获利原则：如果被侵权人的实际损失难以计算，或者侵权人因侵权行为获得的利益明显高于被侵权人的实际损失，法院可能会根据侵权人的获利情况来确定赔偿金额。
   • 法定赔偿原则：在无法确定实际损失或侵权人获利的情况下，法院可能会根据相关法律规定，结合侵权行为的性质、情节、后果等因素，酌情确定赔偿金额。

3. 申请赔偿的途径：

   • 协商：首先，您可以尝试与侵权方进行协商，就赔偿金额和方式达成一致。这种方式成本较低，效率较高，但前提是双方能够坦诚沟通，达成共识。
   • 调解：如果协商无果，您可以考虑通过调解机构进行调解。调解机构可以提供中立的第三方意见，帮助双方找到合理的解决方案。
   • 诉讼：如果协商和调解均无法解决问题，您可以向法院提起诉讼，要求侵权方承担赔偿责任。在诉讼过程中，法院将根据事实和法律规定，对赔偿金额进行裁决。

4. 注意事项：

   • 证据收集：在申请赔偿前，务必收集并保存好与侵权行为相关的证据，如合同文本、侵权行为记录、损失计算依据等。这些证据将在后续的法律程序中发挥关键作用。
   • 法律程序：了解并遵循相关的法律程序，如起诉时效、管辖法院等。确保您的申请在法律框架内进行，提高胜诉的可能性。
   • 专业咨询：在处理复杂的合同纠纷和侵权问题时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况，提供针对性的法律建议和解决方案。

建议：面对合同中的侵权问题，即使合同未约定赔偿金额，您仍然有权申请赔偿。为了确保您的权益得到充分保障，建议您在发现侵权行为后，及时收集证据，并咨询专业律师的意见。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。