擅自更改土地承包合同是违法的，且可能面临严重的法律后果。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》：
- 第五百七十七条：当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
- 若土地承包合同中明确规定了土地的使用方式、期限等，擅自更改即构成违约。
《中华人民共和国土地管理法》：
- 第十二条：依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
- 第五十六条：建设单位使用国有土地的，应当按照土地使用权出让等有偿使用合同的约定或者土地使用权划拨批准文件的规定使用土地；确需改变该幅土地建设用途的，应当经有关人民政府自然资源主管部门同意，报原批准用地的人民政府批准。
- 擅自改变土地用途，未经批准即属违法。
二、法律后果
民事责任：
- 违约方需承担继续履行原合同、采取补救措施或赔偿损失的责任。
- 若因擅自改变土地用途导致土地损毁，还需恢复原状或折价赔偿。
行政责任：
- 土地管理部门可依据《土地管理法》责令限期改正，没收违法所得并处以罚款。
- 情节严重的，甚至可能收回土地使用权。
刑事责任风险：
- 若擅自改变土地用途涉及非法占用耕地且数量较大，造成基本农田破坏等严重后果，可能触犯刑法中的非法占用农用地罪。
三、实际案例
以密云某农业公司为例，该公司承包土地后违规改变土地用途，在荒滩上修建了“管理用房”，并以转包的名义对外出售。最终，法院认定该公司与买家之间的转包协议及回售合同均因违反法律强制性规定而无效，并判决双方在互抵的情况下返还差额。这一案例充分说明了擅自更改土地承包合同的法律后果。
综上所述，擅自更改土地承包合同是违法的，不仅可能面临民事责任、行政责任，甚至可能触犯刑法。因此，在签订和履行土地承包合同时，应严格遵守相关法律法规，确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。