结论：工作时间因自身疾病是否算工伤，需根据具体情况和法律规定综合判断。一般来说，普通疾病发作不算工伤，但在特定条件下，如突发疾病死亡或在48小时内经抢救无效死亡，可视同工伤。

一、一般情况下不算工伤

若职工在工作时间因自身身体原因突发一般性疾病（如感冒、胃炎等），且未导致死亡或未在48小时内经抢救无效死亡，通常不被认定为工伤。这类疾病非由工作直接导致，不符合工伤认定中的“工作原因”要素。在此情况下，员工应使用自己的医疗保险进行救治。

二、特殊情况视同工伤

根据《工伤保险条例》第十五条第（一）项规定，职工在工作时间和工作岗位上，突发疾病死亡或者在48小时之内经抢救无效死亡的，视同工伤。这一规定包含几个关键要素：

1. 工作时间：这指的是法律规定的或者单位要求职工工作的时间，包括劳动合同约定的时间、用人单位规定的加班加点时间，以及完成临时指派工作的时间等。
2. 工作岗位：这是指职工日常所在的工作岗位，以及由本单位领导指派所从事的其他工作岗位。
3. 48小时的计算：“48小时”的起算时间以医疗机构的初次诊断时间为准。这是一个硬指标，如果超过48小时才死亡，则不能视同工伤。

举例说明：

假设某员工在上班过程中突然晕倒，被紧急送往医院。医院初次诊断为突发脑溢血，从这一刻开始计算，如果该员工在48小时之内经抢救无效死亡，那么他的情况就可以视同工伤；反之，若超过48小时才死亡，则不能被认定为工伤。

三、其他相关因素

1. 工作环境与诱因：若高强度工作或恶劣工作环境是突发疾病的重要诱因（如强制加班、违法延长工作时长、工作环境存在有害有毒物质等），且劳动者能举证证明这些因素与疾病发生有直接关系，可能会根据具体情况比照工伤待遇处理。
2. 非因工负伤：若职工在工作时间突发疾病但未构成死亡，且疾病非因工作引起，则只能享受非因工负伤的医疗保险待遇。

四、工伤认定流程

1. 申请：职工所在单位应在事故伤害发生之日起30日内向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。特殊情况下，申请时限可适当延长。若用人单位未在规定时限内提出申请，受伤害职工或其近亲属、工会组织可在事故伤害发生之日起1年内直接提出工伤认定申请。
2. 审核与决定：劳动保障行政部门收到申请后，会对提交的材料进行审核。材料完整的，会作出受理或不予受理的决定；材料不完整的，会一次性书面告知补正要求。劳动保障行政部门一般自受理申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请人及相关方。

五、法律后果与工伤待遇

1. 被认定为视同工伤的法律后果：职工的近亲属可享受工伤保险待遇，包括丧葬补助金、供养亲属抚恤金和一次性工亡补助金。

   • 丧葬补助金为6个月的统筹地区上年度职工月平均工资。
   • 供养亲属抚恤金按照职工本人工资的一定比例发给由因工死亡职工生前提供主要生活来源、无劳动能力的亲属。
   • 一次性工亡补助金标准为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍。

2. 用人单位未缴纳社保的责任：如果用人单位未依法为职工缴纳工伤保险费，而职工被认定为视同工伤，那么原本应由工伤保险基金支付的待遇将由用人单位承担。

总结与建议：

综上所述，工作时间因自身疾病是否算工伤，需根据具体情况来判断。对于员工而言，了解这些规定至关重要。同时，也建议员工平时多注意身体健康，定期进行体检，以减少突发疾病的风险。如果不幸遭遇此类情况，可以直接向我咨询，以便准确了解自己的权益并依法维护。