公司报销1000元以上现金支付是否违法，不能一概而论，需结合具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：
一、法律法规层面
现金管理规定：
- 根据《现金管理暂行条例》及其实施细则，单位之间的经济往来，除规定的范围可以使用现金外，应当通过开户银行进行转账结算。对于大额现金支付，银行有严格的监管措施，以防止洗钱等违法行为。
- 若公司报销1000元以上现金支付，且该支付不属于现金管理规定中允许的现金支付范围（如职工工资、津贴、个人劳务报酬、根据国家规定颁发给个人的科学技术、文化艺术、体育等各种奖金、各种劳保、福利费用以及国家规定的对个人的其他支出、向个人收购农副产品和其他物资的价款、出差人员必须随身携带的差旅费、结算起点以下的零星支出等），则可能违反现金管理规定。但需注意，这里的“结算起点”一般指1000元，但具体是否允许现金支付还需结合支付的具体性质和当地银行的实际操作。
税务合规性：
- 报销行为需符合税务法规，确保发票的真实性、合法性和有效性。若公司以现金形式支付报销款，但无法提供合法有效的发票或凭证，则可能面临税务风险，如被税务机关认定为偷税漏税等。
- 从税务合规性角度看，公司报销1000元以上现金支付本身并不直接违法，但需确保报销的合法性和合规性，包括提供合法有效的发票或凭证。
二、公司内部管理层面
公司财务制度：
- 公司内部通常会有财务制度规定报销的流程和方式。若公司财务制度明确规定了大额报销需通过银行转账等方式支付，则公司报销1000元以上现金支付可能违反公司内部财务制度。
- 公司应建立健全的财务制度，明确报销的流程和方式，以确保公司资金的安全和合规使用。
内部控制和风险管理：
- 现金支付存在较高的风险，如丢失、被盗、被挪用等。公司报销1000元以上现金支付可能增加公司的内部控制和风险管理难度。
- 从内部控制和风险管理的角度看，公司应尽量避免大额现金支付，以降低风险。
三、实际操作建议
遵守现金管理规定和税务法规：
- 公司应严格遵守现金管理规定和税务法规，确保报销的合法性和合规性。对于大额报销，应优先考虑通过银行转账等方式支付。
完善公司财务制度：
- 公司应建立健全的财务制度，明确报销的流程和方式，包括报销的审批、支付、凭证管理等环节。
加强内部控制和风险管理：
- 公司应加强内部控制和风险管理，建立有效的监督机制，防止现金支付过程中的违规行为和风险发生。
若你对公司报销、现金管理或税务合规等方面有进一步的问题或疑虑，可以直接向我咨询。我会结合你的具体情况，为你提供更详细、更专业的法律建议。