结论：员工收了商户的钱，公司是否需要承担责任赔偿，这取决于多个因素，包括员工的行为性质、公司的规章制度以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

一、员工行为性质

1. 职务行为：

   • 如果员工收取商户钱款的行为是在其职务范围内，且是为了公司的利益而进行的，那么这通常被视为职务行为。在这种情况下，如果因员工的行为导致公司需要承担赔偿责任，公司通常不能简单地以员工个人行为为由拒绝赔偿。但公司赔偿后，有权向有过错的员工追偿。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，执行法人或者非法人组织工作任务的人员，就其职权范围内的事项，以法人或者非法人组织的名义实施的民事法律行为，对法人或者非法人组织发生效力。

2. 个人行为：

   • 如果员工收取商户钱款的行为完全出于个人目的，与公司业务无关，且未经公司授权或同意，那么这通常被视为个人行为。在这种情况下，公司一般不需要承担赔偿责任，除非公司存在管理疏忽或制度漏洞等过错。

二、公司规章制度

• 公司应建立健全的规章制度，明确员工的行为规范和禁止性行为。如果员工违反公司规章制度收取商户钱款，公司可以根据规章制度对员工进行处罚，并在必要时向相关部门报告或寻求法律救济。
• 建议：公司应定期对员工进行规章制度培训，确保员工了解并遵守公司规定。同时，公司应建立有效的监督机制，及时发现并纠正员工的不当行为。

三、相关法律法规

• 反商业贿赂法律：如果员工收取商户钱款的行为构成商业贿赂，那么不仅员工个人可能面临法律责任，公司也可能因管理不善或制度漏洞而承担一定的法律责任。
• 劳动合同法：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。如果员工因收取商户钱款而严重违反公司规章制度，公司有权解除劳动合同，并可能无需支付经济补偿。

四、具体情境分析

• 情境一：员工私下收取商户回扣，未告知公司，且用于个人消费。这种情况下，员工行为属于个人行为，公司一般不需承担赔偿责任。但公司应依法对员工进行处理，如解除劳动合同等。
• 情境二：员工在职务范围内收取商户钱款，但未经公司授权或同意，且用于公司业务。这种情况下，员工行为可能构成职务侵占或挪用资金等违法行为，公司应依法追究员工法律责任，并可能需承担一定的管理责任。但具体责任需根据案件事实和法律规定进行判断。

总结与建议：员工收了商户的钱，公司是否需要承担责任赔偿，需根据员工行为性质、公司规章制度以及相关法律法规进行综合判断。为避免类似风险，公司应建立健全的规章制度，加强员工培训和管理，建立有效的监督机制。如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。