学校清明节不放假并不直接违法，但需结合具体情况判断其合理性及是否侵犯学生权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与规定
国家法定节假日：根据《全国年节及纪念日放假办法》第二条，清明节是全体公民放假的节日之一，通常应放假1天（即农历清明当日）。然而，该办法主要适用于国家机关、事业单位等，对于学校的适用性需结合学校的性质及具体情况判断。
学校管理权限：学校，特别是高校，在遵守国家法律法规的前提下，有权根据自身的教学计划和实际情况自主安排假期。这意味着学校在决定是否放假以及如何放假时，享有一定的自主权。
二、学校不放假的合理性
教学计划安排：学校的教学计划通常较为紧凑，有时可能需要在节假日期间进行教学活动或考试。在这种情况下，学校可能会选择不放假以确保教学计划的顺利进行。
学生安全与管理：节假日期间，学生的安全管理成为一大挑战。学校可能出于对学生安全的考虑，选择不放假以减少学生外出带来的安全隐患和管理难度。
特殊情况应对：如遇到突发事件或紧急任务，学校可能需要调整假期安排以应对相关情况。
三、学校不放假的潜在影响与建议
学生权益保障：虽然学校有权自主安排假期，但也应充分考虑学生的权益和需求。如果决定不放假，学校应提前通知学生并说明原因，同时做好相应的教学和生活安排，如提供必要的休息时间、组织有益的活动等，以缓解学生的压力。
沟通与协商：学校在制定假期安排时，可以与学生代表进行沟通协商，听取他们的意见和建议。这有助于增强决策的透明度和合理性，减少因假期安排不当而引发的矛盾和纠纷。
灵活处理：对于因特殊原因无法回家的学生，学校可以提供相应的关怀和帮助，如提供住宿、餐饮等便利条件，或组织活动以丰富学生的假期生活。
四、特殊情况下的法律考量
如果学校既未按国家规定放假，也未进行合理调休或特殊安排，且占用了学生的休息时间进行加班加点上课或补课，那么就可能侵犯了学生的合法权益。在这种情况下，学生或家长可以向学校提出异议，要求学校改正；如果学校不予理会，还可以向当地教育部门投诉或寻求法律援助。
总结与建议：学校清明节不放假并不直接违法，但需结合具体情况判断其合理性及是否侵犯学生权益。学校在制定假期安排时，应充分考虑法律法规的要求和学生的合法权益，确保放假安排的合理性和合法性。如果学生对学校的假期安排有异议，可以与学校进行沟通协商或向相关部门投诉。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。