核心结论：遇到工人工资已支付给班组长但工人仍来讨要工资的情况，需分步骤核实情况、固定证据，并根据不同原因采取相应措施，必要时通过法律途径解决。以下是具体分析：
一、核实工资支付情况的真实性
- 查验支付凭证：首先需确认公司是否确实已将工资支付给班组长。这包括查看转账记录、收据、签收单等书面证据，确保支付行为有据可查。
- 确认支付对象：核实班组长是否确实有权代收工资。根据《劳动法》及相关规定，工资应直接支付给劳动者本人，除非劳动者书面授权他人代收。若班组长未经授权代收，公司可能面临支付风险。
二、与工人及班组长沟通，了解原因
- 与工人沟通：了解工人为何在工资已支付的情况下仍来讨要。可能是班组长未将工资发放给工人，或是工人对工资数额有异议，或是存在其他误解。
- 与班组长沟通：询问班组长是否已将工资发放给工人，若未发放，原因是什么；若已发放，是否有相关证据（如工人签收的工资条、转账记录等）。
三、根据不同原因采取相应措施
- 班组长未发放工资：
- 要求班组长立即发放：若班组长承认未发放工资，应要求其立即发放，并保留相关证据（如聊天记录、录音等）。
- 公司直接支付：若班组长拒绝发放或无法联系，公司可考虑直接向工人支付工资，并保留支付凭证，同时向班组长追偿已支付的工资。
- 报警或起诉：若班组长涉嫌侵占工资，公司可向公安机关报案，或向法院提起民事诉讼，要求班组长返还侵占的工资。
- 工人对工资数额有异议：
- 核对工资计算：与工人一起核对工资计算方式、考勤记录等，确保工资数额准确无误。
- 协商解决：若存在误差，与工人协商补发差额；若无误差，向工人解释清楚工资计算方式，消除误解。
- 存在其他误解：
- 解释说明：向工人解释清楚工资支付流程、班组长代收的原因等，消除工人的疑虑。
- 提供证据：向工人提供工资支付凭证、班组长代收授权书等证据，证明公司已履行支付义务。
四、预防类似情况再次发生
- 完善工资支付制度：明确工资支付流程、支付对象、支付方式等，确保工资支付有章可循。
- 加强班组长管理：对班组长进行培训，明确其代收工资的职责和风险，要求其定期汇报工资发放情况。
- 建立监督机制：设立监督机制，定期对工资支付情况进行检查，确保工资按时足额发放给工人。
总结：遇到此类情况，公司应首先核实工资支付情况的真实性，然后与工人及班组长沟通了解原因，根据不同原因采取相应措施，并预防类似情况再次发生。如有需要，可随时向我咨询相关法律问题。