在检察院因存疑不起诉且无法确定血样酒精含量的情况下，纪委的处理方式需结合具体案情、证据状况及被调查人身份等多方面因素综合判断，通常可能采取以下几种处理路径：

1. 若被调查人系党员干部或公职人员，纪委可能启动党纪政务处分程序
   根据《中国共产党纪律处分条例》及《中华人民共和国公职人员政务处分法》，纪委在调查过程中若发现被调查人存在涉嫌酒驾、醉驾等违反国家法律法规的行为，即使检察院因证据不足作出存疑不起诉决定，纪委仍可依据行政处罚决定（如交警部门已作出酒驾行政处罚）、证人证言、现场监控、行车记录仪等证据，认定其违反廉洁纪律或生活纪律，给予警告、严重警告、撤销党内职务等党纪处分，或警告、记过、降级等政务处分。
   关键点：纪委的处分依据不限于刑事判决，行政处罚或其他证据足以证明违纪事实的，仍可处分。

2. 若证据不足导致无法认定违纪，纪委可能作出结案处理
   若纪委调查后认为，现有证据（如血样酒精含量无法确定、无其他直接证据证明饮酒后驾车）不足以证明被调查人存在违纪行为，根据《中国共产党纪律检查机关监督执纪工作规则》，纪委可经集体审议后作出结案处理，不再继续追责。
   关键点：纪委需遵循“事实清楚、证据确凿”原则，证据不足时不得强行处分。

3. 若涉及其他违纪线索，纪委可能并案调查
   若在调查过程中发现被调查人存在其他违纪行为（如公车私用、接受宴请等），即使酒驾事实无法认定，纪委仍可针对其他违纪线索继续调查，并依据调查结果作出相应处分。
   关键点：纪委的调查范围不限于单一违纪行为，可全面审查被调查人的行为。

4. 若被调查人系非党员干部或公职人员，纪委可能转交其他部门处理
   若被调查人不属于纪委监察对象（如普通企业人员），纪委通常不会直接处理，但可能将线索移交至其所在单位党组织或行业主管部门，由其依据内部规定处理；若涉及违法行为，可建议公安机关重新调查或补充证据。
   关键点：纪委的管辖范围限于党员干部和公职人员，非监察对象需由其他主体处理。

建议：

• 若您或相关人员涉及此类情况，建议尽快整理现有证据（如行政处罚决定、证人证言等），并咨询专业律师评估纪委可能采取的措施；
  
• 若纪委已启动调查，可主动配合调查并说明情况，避免因隐瞒事实导致处分加重；
  
• 若对纪委的处理决定不服，可依据《中国共产党纪律检查机关控告申诉工作条例》等规定提出申诉。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您详细分析。