结论：公司扣代班费是否违法，需根据具体情况判断，包括代班的原因、公司规章制度以及劳动合同的约定等。以下从不同角度进行分析：
一、代班原因与合同约定
若代班是公司安排且劳动合同或规章制度中有明确约定：
- 在这种情况下，代班通常被视为员工工作职责的一部分，公司应按照约定支付相应的报酬，包括代班费。如果公司无故扣除代班费，可能构成违法，员工有权要求公司支付被扣除的费用，并可能依据《劳动合同法》的相关规定，要求公司承担相应的法律责任。
若代班是员工自愿且未与公司达成任何约定：
- 如果员工自愿代班，且没有与公司就代班费进行明确约定，那么公司扣除代班费的行为可能不直接构成违法。但员工仍可以与公司协商，要求公司支付一定的补偿或认可其额外的工作付出。
二、公司规章制度与合法性
公司规章制度合法且明确规定代班费支付：
- 如果公司的规章制度合法有效，并且明确规定了代班费的支付方式和标准，那么公司应按照规章制度执行。如果公司违反规章制度扣除代班费，员工可以依据规章制度要求公司支付被扣除的费用。
公司规章制度不合法或未规定代班费：
- 如果公司的规章制度存在违法内容，或者未对代班费进行规定，那么公司扣除代班费的行为可能缺乏合法依据。员工可以与公司协商，或者向劳动监察部门投诉，要求公司支付被扣除的费用。
三、法律建议与行动指南
与公司协商：
- 首先，建议员工与公司进行友好协商，明确代班的原因、性质以及代班费的支付问题。通过协商，双方可以达成一致意见，避免不必要的法律纠纷。
查阅劳动合同和规章制度：
- 员工应仔细查阅自己的劳动合同和公司的规章制度，了解其中关于代班和代班费的规定。如果发现公司存在违法行为，可以依据相关规定要求公司支付被扣除的费用。
向劳动监察部门投诉：
- 如果公司拒绝支付被扣除的代班费，或者员工对公司的处理结果不满意，可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门将依法进行调查处理，并保障员工的合法权益。
寻求法律援助：
- 在必要时，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师，以了解自己的法律权益和可行的法律途径。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和帮助。
后续思考依据：在判断公司扣代班费是否违法时，需要综合考虑代班的原因、公司规章制度以及劳动合同的约定等多个因素。如果员工对公司的处理结果存在疑问或不满，应及时采取行动维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。