针对您因举报公司非法经营而遭公司人员殴打致轻微伤的情况，处理方式主要分为刑事、行政及民事赔偿三个层面，具体如下：

1. 刑事层面：可能构成故意伤害罪
   根据《刑法》第234条，故意伤害他人身体致轻伤的，处三年以下有期徒刑、拘役或管制。您已构成轻微伤（需以司法鉴定为准），若对方存在故意伤害行为，可向公安机关报案，要求立案侦查。若公安机关认为不构成刑事案件，可要求出具《不予立案通知书》，并申请复议或向检察院申诉。
   关键点：轻微伤通常不直接触发刑事责任，但若结合殴打动机（如报复举报）、手段恶劣等情节，可能升级为寻衅滋事罪或其他罪名，需结合具体证据判断。

2. 行政层面：公安机关可行政处罚
   即使不构成刑事犯罪，根据《治安管理处罚法》第43条，殴打他人的可处5-10日拘留，并处200-500元罚款；情节较轻的处5日以下拘留或500元以下罚款。若存在结伙殴打、多次殴打等情形，处罚更重。
   操作建议：立即报警并保留就医记录、伤情照片等证据，要求公安机关出具《受案回执》并跟进处理进度。

3. 民事赔偿：可主张医疗费、误工费等损失
   根据《民法典》第1179条，侵害他人造成人身损害的，应赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、误工费等合理费用。若构成伤残，还可主张残疾赔偿金。
   流程提示：可先通过公安机关调解，若调解不成，可向法院提起民事诉讼，需准备医疗费发票、收入证明、鉴定意见等证据。

额外提醒：

• 若公司指使或纵容员工实施殴打，公司可能需承担连带赔偿责任（《民法典》第1191条）；
  
• 举报公司非法经营属合法行为，若因此遭打击报复，可同步向劳动监察部门投诉或申请工伤认定（若构成工伤）；
  
• 伤情鉴定是关键，务必在受伤后24小时内报警并由公安机关指定机构鉴定，避免自行委托导致证据效力问题。

建议行动步骤：

1. 立即报警并要求做伤情鉴定；
   
2. 收集举报证据（如书面材料、聊天记录等）及被打证据（监控、证人、医疗记录）；
   
3. 同步向劳动监察部门反映公司非法经营及打击报复行为；
   
4. 根据公安机关处理结果，决定是否提起刑事自诉或民事诉讼。
   

如有进一步细节需补充（如公司规模、殴打具体情节等），可随时告知，我会为您细化分析。