当现役军人的购房合法权益受到侵害时，部队可以通过向相关政府部门或机构发函来协调解决，具体可以向以下几个部门发函：
当地房地产管理部门：
- 房地产管理部门是负责房地产市场监管和管理的政府机构，对于购房过程中出现的权益侵害问题，如开发商违约、房屋质量问题等，具有直接的监管和处理职责。部队可以向当地房地产管理部门发函，详细说明现役军人购房合法权益受到侵害的具体情况，请求该部门介入调查并协调解决。
当地住房和城乡建设部门：
- 住房和城乡建设部门在房地产市场调控、住房保障等方面发挥着重要作用。如果现役军人的购房合法权益受到侵害与住房政策、规划等相关，部队可以向该部门发函，寻求政策支持和协调解决。
当地政府信访部门：
- 信访部门是政府接收群众来信来访、协调解决群众问题的窗口。部队可以通过向当地政府信访部门发函，反映现役军人购房合法权益受到侵害的问题，请求该部门协调相关部门进行调查处理。
军事法院或地方人民法院（如涉及诉讼）：
- 如果现役军人的购房合法权益受到严重侵害，且通过行政协调无法解决，部队可以考虑通过法律途径维护军人的合法权益。在这种情况下，部队可以向军事法院或地方人民法院发函（或指导军人本人提起诉讼），说明情况并请求法律支持。不过，这一步骤通常是在其他行政协调手段无效后采取的。
在发函时，部队应注意以下几点：
- 详细说明情况：在函件中应详细、准确地描述现役军人购房合法权益受到侵害的具体情况，包括时间、地点、涉及人员、侵害方式等。
- 提供证据材料：如果可能，应附上相关证据材料，如购房合同、付款凭证、照片、视频等，以支持函件中的陈述。
- 明确请求事项：在函件中应明确提出部队的请求事项，如要求相关部门介入调查、协调解决、给予政策支持等。
- 保持沟通联系：在发函后，部队应保持与相关部门的沟通联系，及时了解处理进展，并根据需要提供进一步的协助和支持。
此外，如果现役军人本人能够直接与相关部门沟通或寻求法律帮助，也是值得鼓励的。部队可以提供必要的支持和指导，帮助军人维护自己的合法权益。
最后，如果现役军人在购房过程中遇到任何法律问题或权益受到侵害，都可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。