针对高标准农田建设施工方工程不合格导致无法耕种的问题，您可以按照以下步骤来处理：
收集证据：
- 首先，您需要收集所有与高标准农田建设相关的证据，包括但不限于施工合同、施工图纸、验收报告、现场照片或视频等。这些证据将用于证明施工方的工程确实存在不合格的情况，以及这种不合格对农田耕种造成了影响。
与施工方协商：
- 在收集到足够证据后，您可以尝试与施工方进行协商，要求其按照合同约定或相关法律法规进行整改，直至达到可以耕种的标准。协商过程中，您可以明确提出整改的期限和要求，并保留好协商记录。
申请第三方评估：
- 如果协商无果，您可以考虑申请第三方评估机构对农田进行评估，以确定工程不合格的具体情况和损失程度。评估报告将作为后续法律程序的重要依据。
寻求法律途径解决：
- 提起诉讼：如果施工方拒绝整改或整改后仍不符合要求，您可以向人民法院提起诉讼，要求施工方承担违约责任，包括赔偿损失、恢复原状等。在诉讼过程中，您需要提交之前收集的证据和评估报告，以支持您的主张。
- 申请仲裁：如果施工合同中约定了仲裁条款，您也可以选择向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁程序相对灵活，且裁决具有法律效力，可以快速解决纠纷。
关注后续整改和赔偿：
- 无论通过诉讼还是仲裁，一旦获得胜诉判决或裁决，您需要关注施工方的后续整改和赔偿情况。如果施工方不履行判决或裁决，您可以向人民法院申请强制执行。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，施工方应当按照合同约定和国家相关标准进行施工，确保工程质量符合要求。如果施工方违反合同约定或国家相关标准，导致工程质量不合格，应当承担违约责任。
- 在处理此类纠纷时，建议您保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。同时，也建议您在未来的合同签订中明确约定工程质量标准、验收程序以及违约责任等条款，以减少类似纠纷的发生。
可能面临的法律后果：
- 如果施工方被认定存在违约行为，可能需要承担赔偿损失、恢复原状等法律责任。具体赔偿金额将根据损失程度、合同约定以及相关法律法规进行确定。
- 如果施工方拒绝履行判决或裁决，可能会面临被强制执行的风险，包括但不限于财产被查封、冻结或划拨等。
如有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供更详细的法律建议和指导。