企业被合并时，员工确实有权选择去留，但具体权利和选择方式需根据合并类型、劳动合同履行情况以及相关法律法规来确定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合并类型与员工选择权
吸收合并：
- 在吸收合并中，一家公司（吸收方）吸收另一家公司（被吸收方）的全部资产和负债，被吸收方解散。
- 员工选择：被吸收方的员工原则上应转入吸收方继续工作，劳动合同由吸收方承继。但员工有权根据个人意愿和职业规划，选择是否接受这一安排。如果员工不愿意转入吸收方，可以依据《劳动合同法》的相关规定，与被吸收方协商解除劳动合同，并获得相应的经济补偿。
新设合并：
- 在新设合并中，两家或多家公司合并成立一家新公司，原公司均解散。
- 员工选择：原公司的员工原则上应转入新公司继续工作，劳动合同由新公司承继。同样，员工也有权选择是否接受这一安排。如果员工不愿意转入新公司，可以与原公司协商解除劳动合同，并获得经济补偿。
二、劳动合同履行情况与员工选择权
劳动合同继续履行：
- 在合并过程中，如果员工的劳动合同能够继续履行，且员工愿意继续在新公司（吸收方或新设公司）工作，那么劳动合同应继续有效，员工应继续履行其职责。
劳动合同变更或解除：
- 如果因合并导致劳动合同无法继续履行（如工作地点、岗位等发生重大变化），或者员工不愿意继续在新公司工作，那么双方可以协商变更劳动合同内容或解除劳动合同。
- 解除劳动合同的经济补偿：根据《劳动合同法》的规定，如果因合并导致劳动合同解除，且非员工原因，员工有权获得经济补偿。经济补偿的标准通常按照员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
三、法律法规与员工权益保障
《劳动合同法》的相关规定：
- 该法明确了劳动合同的变更、解除和终止的条件和程序，以及经济补偿的标准和支付方式。在合并过程中，公司应严格遵守这些规定，保障员工的合法权益。
员工维权途径：
- 如果员工在合并过程中遇到权益受损的情况，如未获得经济补偿、劳动合同被非法解除等，可以通过劳动争议调解仲裁机构或人民法院进行维权。
四、实际操作建议
提前沟通：
- 在合并过程中，公司应提前与员工进行沟通，说明合并的情况、对员工的影响以及员工的权利和选择方式。这有助于减少员工的疑虑和不安，促进合并的顺利进行。
签订书面协议：
- 如果员工选择转入新公司或解除劳动合同，应与公司签订书面协议，明确双方的权利和义务。这有助于避免后续纠纷的发生。
关注法律法规变化：
- 由于法律法规可能会随着时间和政策的变化而调整，公司和员工都应关注相关法律法规的变化，确保自己的行为符合法律要求。
总结来说，企业被合并时，员工确实有权选择去留。但具体权利和选择方式需根据合并类型、劳动合同履行情况以及相关法律法规来确定。如果您在合并过程中遇到任何法律问题或权益受损的情况，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。