结论：一户两宅中，若另一处宅基地未获批准，但房屋已建成，能否确权合法居住需视具体情况而定。以下从合法与不合法两种情形进行详细分析：

一、合法情形下的确权与居住

1. 因继承房屋获得：

   • 根据“地随房走”的原则，如果户主是通过继承地上房屋而占用宅基地，形成的一户两宅是合法的。在这种情况下，户主可以进行确权登记，并合法居住。

2. 符合分户条件但未分户：

   • 若户主符合分户建房条件，虽未办理分户手续但已另行建房，且经过本农民集体同意并公告无异议，补办用地手续后，也可依法确权登记，并合法居住。

3. 面积总和符合规定：

   • 如果两处宅基地的总面积未超过当地规定的宅基地面积标准，那么这两处宅基地可以视同一处宅基地进行确权，户主可以合法居住。

4. 合法买卖获得：

   • 在同一集体经济组织内部，如果户主通过合法的房屋买卖交易获得了两处宅基地，且交易符合相关规定，那么这两处宅基地也可以进行确权，户主可以合法居住。

二、不合法情形下的处理

1. 未经批准擅自占地：

   • 如果户主未经过合法审批程序私自占用土地建造第二处宅基地，这属于违法占地行为。在这种情况下，第二处宅基地不能进行确权，且可能面临拆除、罚款等处罚。因此，户主不能合法居住在该宅基地上。

2. 不符合分户条件却分户建房：

   • 如果户主通过不正当手段分户并新建宅基地，这种情况也无法进行确权。户主同样不能合法居住在该宅基地上，且可能面临法律责任。

三、建议与注意事项

1. 了解当地政策：

   • 由于地区差异，处理一户两宅的方式可能有所不同。因此，户主应先了解当地的政策和规定，以便更好地处理自己的宅基地问题。

2. 合规操作：

   • 在处理一户两宅问题时，户主务必遵守相关法律法规和政策要求，确保操作的合规性和合法性。避免因为违规操作而面临法律责任和财产损失。

3. 及时咨询与处理：

   • 如果户主对宅基地确权存在疑问或遇到相关问题，应及时向我咨询，以便获取准确的指导和帮助。我会根据具体情况为户主提供专业的法律意见和解决方案。

举例说明：假设某户主原本拥有一处宅基地，后因继承获得另一处宅基地上的房屋。根据“地随房走”的原则，该户主可以依法对这两处宅基地进行确权登记，并合法居住。但如果该户主未经批准擅自占用土地建造了第二处宅基地，那么这处宅基地就不能进行确权，且可能面临拆除等处罚。

后续行动建议：户主应首先确认自己两处宅基地的合法性，如果存在疑问或不确定的情况，应及时向我咨询。同时，户主也应关注当地政策和规定的变化，以便及时调整自己的宅基地使用策略。