针对您提出的“一户两宅合法宅基地能否确权”的问题，这确实是一个涉及农村宅基地管理和确权登记的重要议题。以下是我根据相关法律法规及实际操作经验，为您提供的详细解答：
一、可予以确权的情形
合法继承导致的“一户两宅”：
- 如果您家中的一处宅基地上的房屋是通过合法继承方式获得的，那么根据“地随房走”的原则，您作为继承人可以依法获得该宅基地的使用权，并进行确权登记。但前提是继承行为必须符合当地关于宅基地继承的相关规定，且继承关系清晰明确。
合法分户导致的“一户两宅”：
- 当您的家庭成员达到法定分户条件（如子女已婚、有稳定经济来源等），并经过合法审批程序分别申请了宅基地，从而形成的一户两宅情况，只要分户和宅基地申请审批手续齐全且符合当地规定，那么这两宗宅基地都是可以进行确权登记的。
二、不符合规定情形的处理方式
超规定面积部分的处理：
- 如果您的宅基地面积超出了当地规定的标准，且这部分超面积是历史原因形成的，那么在确权时通常会标注超面积部分，并在未来房屋翻建、改建时按规定面积标准进行调整。但如果是违法超占面积，则需依法依规处理，可能包括退还超占部分土地或面临其他行政处罚。
非法获得的宅基地的处理：
- 如果您家中的其中一宅是通过未经批准擅自占用集体土地建设房屋等非法手段获得的，那么这处宅基地通常是不能进行确权的。相关部门会责令您退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用土地上新建的房屋。
有偿退出或转让：
- 对于不愿或无法进行分户的家庭，您可以考虑将多余的宅基地有偿退出或转让给同村其他需要宅基地的村民。这种方式有助于实现土地资源的合理利用，但需确保转让过程符合相关法律法规，并办理好相关手续。
依法拆除：
- 如果以上方式均不适用，或者您家的多处宅基地存在严重违反相关法律法规和村庄规划的情况，那么可能需要依法对多余的宅基地进行拆除。在拆除前，相关部门会进行充分的调查和评估，确保拆除行为的合法性、合理性和公正性。
三、确权流程与注意事项
确权流程：如果您家的宅基地符合确权条件，您可以向乡（镇）人民政府提出确权申请，并提交相关证明材料（如身份证明、宅基地使用证明、房屋所有权证明等）。乡（镇）人民政府会审核申请材料，并组织实地调查和测量。审核通过后，由县级以上人民政府进行确权登记，并颁发土地使用权证书。
注意事项：在确权过程中，您应充分了解并遵守当地关于宅基地管理和确权登记的相关规定和要求。同时，保持与当地相关部门的沟通联系，及时咨询和解决确权过程中遇到的问题和困难。
综上所述，“一户两宅”合法宅基地能否确权需根据具体情况灵活决定。如果您的宅基地符合确权条件且手续齐全，那么是可以进行确权登记的。但如果不符合规定或存在违法情况，则需按照相关法律法规进行处理。希望以上解答能对您有所帮助。