一宅两户没有分别确权，在一般情况下是不合法的。以下从几个方面进行详细分析：

一、法律背景与原则

根据《中华人民共和国民法典》及相关土地管理法规，宅基地使用权是农村村民基于其集体经济组织成员身份而享有的福利性权利，具有身份性和福利性。宅基地使用权通常以“户”为单位进行分配和确权，但“户”内的具体成员对宅基地的使用权应当是明确且无争议的。如果一宅两户没有分别确权，就可能导致宅基地使用权的归属不明确，容易引发纠纷。

二、分别确权的必要性

1. 明确使用权归属：分别确权可以清晰地界定每一户对宅基地的具体使用权范围，避免因为使用权不明确而产生的争议和冲突。
2. 保障合法权益：通过确权，可以确保每一户的合法权益得到法律的保护，防止因为宅基地使用权问题而导致的权益受损。
3. 促进农村稳定：明确宅基地使用权归属，有助于维护农村社会的稳定和和谐，减少因为土地问题而引发的社会矛盾。

三、未分别确权的法律后果

1. 可能引发纠纷：如果一宅两户没有分别确权，当其中一户想要对宅基地进行改造、转让或继承时，就可能因为使用权不明确而与另一户产生纠纷。
2. 影响权益实现：未确权的宅基地使用权在法律上可能得不到充分的保护，当权益受到侵害时，可能难以通过法律途径进行维权。
3. 面临行政处罚：在极端情况下，如果因为未确权而导致宅基地使用混乱，还可能面临相关行政部门的处罚。

四、建议与措施

1. 及时确权：如果一宅两户尚未分别确权，建议尽快向相关部门申请确权，明确每一户对宅基地的具体使用权范围。
2. 协商解决：在确权过程中，如果两户之间存在争议或分歧，可以通过协商的方式解决，尽量达成一致意见。
3. 寻求法律帮助：如果协商无果或争议较大，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径解决争议。

总结来说，一宅两户没有分别确权在一般情况下是不合法的，可能引发纠纷、影响权益实现并面临行政处罚。因此，建议尽快进行确权，明确每一户对宅基地的具体使用权范围。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。