结论：一宅两户不经过分户直接过户，在大多数情况下是不合法的，但具体需结合房屋性质、产权归属及地方政策综合判断。以下分情况详细说明：

1. 若房屋为农村宅基地房，不经过分户直接过户通常违法

• 法律依据：根据《土地管理法》及农村宅基地管理政策，宅基地使用权以“户”为单位分配，一户只能拥有一处宅基地。若两户共用一处宅基地，需先通过分户手续明确各自权属，否则无法直接过户。
• 操作风险：未分户直接过户可能导致产权纠纷，例如：过户后一方反悔主张共有权，或涉及拆迁补偿时因权属不清引发争议。
• 例外情形：若地方政策允许“一宅多户”且明确过户流程（如部分地区试点），需以当地国土部门或村委会的书面文件为准，但此类情形极少。

2. 若房屋为城镇商品房，一宅两户可能涉及产权分割问题

• 共有产权处理：若两户为共同共有（如夫妻、父子），需通过共有权证分割或协议约定份额后过户；若为按份共有，需明确各自比例并办理变更登记。
• 借住或租赁关系：若另一户仅为借住或租赁，无产权份额，则过户无需其同意，但需注意租赁合同是否影响买卖（如“买卖不破租赁”原则）。
• 风险提示：未明确产权关系直接过户，可能导致买方无法取得完整产权，或卖方被追责违约。

3. 地方政策差异需重点核查

• 分户要求：部分城市（如北京、上海）对分户有严格限制，需满足户籍、居住面积等条件；农村地区可能要求分户后另行申请宅基地。
• 过户流程：需向当地不动产登记中心咨询具体材料（如分户证明、共有权协议、村委会/居委会同意书等），擅自操作可能被拒登。

4. 合法过户的必要步骤

• 分户手续：向户籍管理部门申请分户，取得独立户口本。
• 产权确认：通过协议、公证或诉讼明确各自产权份额。
• 登记变更：携带分户证明、产权协议等材料，至不动产登记中心办理过户。

建议：若涉及一宅两户过户，务必先核查房屋性质、地方政策，并完成分户及产权确认手续。如有疑问，可直接向我咨询具体操作流程及风险防范。