单位帮交的款项是否算入个人账户以及是否合法，需分情况讨论：
若单位帮交款项为工资、奖金等合法收入：
- 算入个人账户：根据《中华人民共和国民法典》第一千零六十二条，夫妻在婚姻关系存续期间所得的工资、奖金、劳务报酬等，属于夫妻共同财产。若单位帮交的款项属于此类收入，且没有特殊约定（如婚前协议、赠与合同等明确归一方所有），则该款项应算入个人账户（在夫妻共同财产的语境下，即视为夫妻共同所有，但实际存入的是个人账户），且是合法的。
- 合法性依据：单位按照劳动合同或相关约定，将工资、奖金等合法收入支付给员工，员工有权接收并存入个人账户。这是正常的劳动报酬支付流程，不违反法律规定。
若单位帮交款项为公司财产或存在其他非法情形：
- 不算入个人账户（或算入但非法）：如果单位帮交的款项实际上属于公司财产，如公司资金被非法转入个人账户，或者存在其他非法情形（如贪污、挪用公款等），则该款项不应算入个人账户（或即使算入也是非法的）。
- 非法性依据：公司财产与私人财产应严格区分。公司账户的资金属于公司所有，而非法定代表人或股东的个人财产。未经合法程序或授权，将公司资金转入个人账户可能构成对公司财产的非法侵占或挪用，违反《中华人民共和国公司法》中关于公司财产保护、股东权利与义务以及公司财务管理等相关规定。
针对不同情况的具体建议：
对于员工：
- 如果单位帮交的款项是工资、奖金等合法收入，且没有特殊约定，可以放心接收并存入个人账户。
- 如果对款项的性质有疑问，或者担心存在非法情形，应及时向单位财务或人事部门咨询，并保留好相关证据（如工资条、转账记录等）。
对于单位：
- 应确保帮交的款项属于合法收入，且符合公司财务管理规定。
- 避免将公司资金非法转入个人账户，以免构成对公司财产的非法侵占或挪用。
- 如果需要为员工支付款项，应通过正规渠道和合法方式进行，确保资金来源和去向的合法性和透明性。
可能涉及的法律后果：
- 如果单位帮交的款项属于非法收入或存在非法情形，相关人员可能面临法律责任，包括但不限于民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
- 对于员工而言，如果接收了非法款项，可能面临被追缴、罚款等风险；对于单位而言，如果涉及公司财产非法侵占或挪用，可能面临公司声誉受损、法律诉讼等后果。
综上所述，单位帮交的款项是否算入个人账户以及是否合法，需根据款项的性质和具体情况进行判断。如果有任何疑问或担忧，建议直接向我咨询，以便获得更具体和专业的法律建议。