在网络侵权案件中，若被侵权人在起诉时住所发生变更，管辖法院的确定需依据相关法律规定及具体情况来分析。以下是从不同角度对此问题的详细解答：

1. 一般管辖原则：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。在网络侵权案件中，若被侵权人起诉时住所已变更，但变更后的住所并非其经常居住地（即连续居住一年以上的地方），且被告住所地或经常居住地未发生变化，则通常仍由被告住所地或经常居住地人民法院管辖。

2. 特殊管辖原则——侵权行为地：

   • 在网络侵权案件中，侵权行为地包括侵权行为实施地和侵权结果发生地。若被侵权人起诉时住所发生变更，但该变更后的住所可以视为侵权结果发生地（例如，被侵权人因网络侵权行为在其新住所遭受了精神损害或财产损失），则被侵权人可以选择向侵权结果发生地（即其新住所所在地）的人民法院提起诉讼。
   • 需要注意的是，侵权结果发生地的确定需结合具体案情来判断。若被侵权人仅因住所变更而主张新住所为侵权结果发生地，但并未提供充分证据证明该新住所与侵权行为有直接关联，则法院可能不予认可。

3. 协议管辖与应诉管辖：

   • 若双方当事人在网络侵权行为发生前或发生后，通过书面协议约定了管辖法院，且该协议不违反级别管辖和专属管辖的规定，则被侵权人应按照协议约定的法院提起诉讼。
   • 若被告在答辩期内未对管辖权提出异议，并应诉答辩的，视为受诉人民法院有管辖权（即应诉管辖）。但这一原则并不适用于所有情况，特别是当存在专属管辖或级别管辖等强制性规定时。

4. 实际操作建议：

   • 在网络侵权案件中，若被侵权人起诉时住所发生变更，建议被侵权人首先收集并整理相关证据，以证明其新住所与侵权行为之间的关联性（如网络侵权行为对其新住所造成的具体损害等）。
   • 同时，被侵权人应咨询专业律师，根据具体案情和法律规定，选择最合适的管辖法院提起诉讼。律师可以根据案件的具体情况，为被侵权人提供详细的法律分析和诉讼策略建议。

总结来说，网络侵权案件中管辖法院的确定需综合考虑多种因素，包括被告住所地、侵权行为地、协议管辖以及应诉管辖等。若被侵权人起诉时住所发生变更，应根据具体情况和法律规定来选择合适的管辖法院。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。