针对您提出的“法院判决股权变更后公司不配合怎么办”的问题，我理解您的核心诉求是在获得法院关于股权变更的生效判决后，面对公司不配合办理相关手续的情况，如何寻求法律救济。以下是我从多个角度为您分析并提供的建议：
明确公司不配合的具体表现及法律后果：
- 公司不配合可能表现为拒绝办理工商变更登记、拒绝出具股权转让证明、拒绝更新股东名册等。这些行为均违反了法院生效判决的效力，也违反了公司法关于股东权利保护的相关规定。
- 根据《公司法》及相关司法解释，股东有权要求公司履行其义务，包括办理股权变更登记等。公司拒不履行的，股东可以依法向法院申请强制执行。
申请法院强制执行：
- 执行依据：您应持有法院关于股权变更的生效判决书或裁定书，这是申请强制执行的法律依据。
- 执行程序：向作出判决的法院提交强制执行申请书，并附上生效判决书、执行申请书副本等材料。法院在审查后，会向公司发出执行通知书，责令其履行义务。
- 执行措施：若公司仍不履行，法院可以采取查封、扣押、拍卖等强制措施，甚至对公司及其法定代表人采取罚款、拘留等处罚措施，以促使公司履行义务。
考虑其他法律途径：
- 股东名册变更诉讼：如果公司拒绝更新股东名册，您可以向法院提起诉讼，要求公司确认您的股东身份并更新股东名册。
- 损害赔偿诉讼：若公司的不配合行为给您造成了经济损失，如股权转让款无法及时到账、股东权益受损等，您可以向法院提起损害赔偿诉讼，要求公司赔偿您的损失。
实际操作中的注意事项：
- 保留证据：在申请强制执行或提起其他诉讼前，务必保留好所有与股权变更相关的证据，包括股权转让协议、法院判决书、公司不配合的证据等。
- 及时沟通：在采取法律行动前，可以尝试与公司进行沟通，了解其不配合的具体原因，并尝试通过协商解决问题。这有助于减少诉讼成本和时间。
- 寻求专业帮助：股权变更涉及复杂的法律问题，建议您在处理过程中寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保护。
针对您可能关心的后续行动建议：
- 如果公司仍然拒绝配合，您应尽快向法院申请强制执行，以避免因拖延而造成不必要的损失。
- 在申请强制执行的同时，您可以考虑与公司进行协商，寻求和解的可能性。如果双方能够达成和解协议，可以节省诉讼成本和时间。
- 如果公司的不配合行为给您造成了严重损失，您还可以考虑向相关部门投诉或举报公司的违法行为。
最后，我想强调的是：面对公司不配合办理股权变更手续的情况，您不应感到无助或绝望。通过法律途径，您可以有效地维护自己的合法权益。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。