子公司将工会费交给总公司是否合法，需分情况讨论：
若子公司与总公司存在明确的财务或管理协议，且该协议符合法律法规及工会章程的规定：
- 在这种情况下，子公司将工会费交给总公司可能是合法的。例如，如果子公司与总公司之间有关于工会经费管理的内部协议，且该协议得到了工会组织的认可，同时符合《中华人民共和国工会法》等相关法律法规的规定，那么这种做法就是合法的。工会经费的使用和管理应当遵循相关法律法规和工会章程，确保经费的合理使用和透明管理。
若子公司与总公司之间没有明确的协议，或者协议内容违反法律法规及工会章程的规定：
- 在这种情况下，子公司将工会费交给总公司可能是不合法的。工会经费是工会组织用于开展活动、维护职工权益的重要资金来源，其使用和管理应当受到严格的监管。如果子公司未经工会组织同意，擅自将工会费交给总公司管理或使用，就可能构成对工会经费的侵占或挪用，这是违法的行为。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国工会法》等相关法律法规，工会经费的来源、使用和管理都有明确的规定。工会组织应当建立独立的经费账户，实行独立核算，确保经费的合理使用和透明管理。任何单位和个人都不得侵占、挪用工会经费。
- 建议：
- 对于子公司而言，如果确实需要将工会费交给总公司管理或使用，应当事先与工会组织进行协商，并签订明确的协议。协议内容应当符合法律法规和工会章程的规定，确保工会经费的合法使用和管理。
- 对于总公司而言，如果接受子公司的工会费，应当建立专门的账户进行管理，并确保经费的合理使用和透明管理。同时，总公司也应当接受工会组织的监督和审计，确保经费的合法性和合规性。
可能存在的法律后果：
- 如果子公司或总公司违反了相关法律法规和工会章程的规定，擅自侵占、挪用工会经费，就可能面临法律责任。这包括但不限于行政处罚、民事赔偿以及刑事责任等。因此，建议子公司和总公司在处理工会经费问题时，务必谨慎行事，确保合法合规。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。