若您明知违规报销后进行了自查自纠并主动退款，这一行为本身体现了您的悔过态度，但具体法律后果仍需结合实际情况分析，以下是详细说明：

1. 主动退款的法律意义
   根据《刑法》及相关司法解释，主动退赃退赔是重要的量刑情节。若您在违规报销行为被发现前主动退款，可视为“自动投案”或“悔罪表现”，可能被认定为“情节轻微”，从而减轻或免除处罚。例如，在贪污贿赂类案件中，主动退款可能使行为从“犯罪既遂”转化为“犯罪中止”或“未遂”，显著降低法律风险。

2. 需结合违规性质与金额判断

   • 行政违规层面：若违规报销涉及违反单位财务制度或《财政违法行为处罚处分条例》，主动退款后，单位可能仅给予行政处分（如警告、记过），而不再追究法律责任。
     
   • 刑事犯罪层面：若违规报销金额较大（如达到职务侵占罪或贪污罪的立案标准），主动退款虽可减轻处罚，但无法完全免除刑事责任。此时，需结合是否具有自首、立功等情节综合判断。

3. 建议采取的补救措施

   • 书面说明情况：向单位或相关部门提交书面材料，详细说明违规事实、退款金额及时间，并表达悔过态度。
     
   • 配合调查：若单位或司法机关介入调查，应如实陈述事实，避免隐瞒或伪造证据，否则可能加重处罚。
     
   • 完善内部制度：建议单位修订财务报销制度，明确违规责任及处理流程，从源头避免类似问题。

4. 潜在风险防范

   • 避免“选择性退款”：若仅退还部分金额，可能被认定为“未完全退赃”，影响量刑情节的认定。
     
   • 注意证据留存：保留退款凭证、书面说明等材料，以备后续需要。
     
   • 咨询专业意见：若涉及复杂法律问题（如金额巨大、跨部门违规等），可进一步向我咨询，我会结合具体案情提供针对性建议。

总结：主动退款是降低法律风险的关键步骤，但需结合违规性质、金额及补救措施综合判断后果。建议您尽快完成退款并配合调查，同时完善内部管理，避免问题扩大。如有进一步疑问，可直接向我提问。