事业单位只发基本工资是否合理，不能一概而论，需结合具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：

一、从劳动合同或聘用合同的角度

1. 合同约定优先：如果事业单位与员工签订的劳动合同或聘用合同中明确约定了工资构成，包括基本工资、绩效工资、奖金等，且约定了发放条件和方式，那么事业单位应按照合同约定发放工资。若事业单位仅发放基本工资，而未按照合同约定发放其他部分，则可能构成违约，员工有权要求事业单位按照合同约定补发工资。

2. 合同未明确约定：如果合同中未明确约定工资构成，或者约定不明确，那么事业单位在发放工资时，应遵循公平、合理的原则，结合员工的工作表现、岗位性质、行业水平等因素进行确定。在这种情况下，如果事业单位仅发放基本工资，而员工认为不合理，可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决争议。

二、从法律法规的角度

1. 最低工资标准：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，事业单位应确保员工的工资不低于当地最低工资标准。如果基本工资低于最低工资标准，那么事业单位的行为显然是不合法的，员工有权要求事业单位补足差额。

2. 工资支付规定：事业单位应按照国家规定和合同约定，按时足额支付员工工资。如果事业单位无正当理由仅发放基本工资，可能涉嫌违反工资支付规定，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

三、从实际情况的角度

1. 特殊情况下的工资发放：在某些特殊情况下，如事业单位面临经营困难、资金紧张等，可能暂时无法按照合同约定发放全部工资。在这种情况下，事业单位应与员工进行充分沟通，说明情况，并争取员工的理解和支持。同时，事业单位应尽快采取措施解决资金问题，确保员工的合法权益不受损害。

2. 员工绩效与工资挂钩：如果事业单位实行绩效工资制度，员工的工资与绩效挂钩，那么在员工绩效不佳的情况下，事业单位可能只发放基本工资。但这种情况下，事业单位应确保绩效评估的公正性和合理性，避免主观臆断或恶意扣减工资。

法律建议

1. 审查合同：员工应首先审查自己的劳动合同或聘用合同，了解工资构成和发放条件。
2. 沟通协商：如果认为事业单位的工资发放不合理，可以与事业单位进行沟通协商，寻求解决方案。
3. 寻求法律援助：如果沟通协商无果，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，必要时也可以寻求律师的法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。

总之，事业单位只发基本工资是否合理，需结合具体情况分析。如果你遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。