药店月末离职，员工是有工资的。这是基于我国劳动法律法规的基本规定，以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者提供了正常劳动，用人单位就应当按照劳动合同约定的工资标准支付工资。工资支付周期通常是一个月，无论员工是在月初、月中还是月末离职，只要其在这个工资支付周期内提供了劳动，就有权获得相应的工资报酬。
具体来说，如果员工在月末离职，且已经完成了当月的工作任务或者提供了相应的劳动，那么药店应当按照员工实际出勤天数和工作表现，结算并支付当月的工资。如果药店拖欠或者拒不支付工资，员工有权向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
实际操作角度
在实际操作中，药店月末离职员工的工资结算可能会涉及一些具体的问题，比如：
工资结算时间：药店通常会在员工离职后的下一个工资支付日结算并支付离职员工的工资。但具体时间可能因药店的财务制度和规定而有所不同，有的药店可能会提前结算，有的则可能会稍有延迟。不过，无论何时结算，药店都应当确保在合理的时间内支付工资，不得无故拖欠。
工资计算方式：离职员工的工资计算应当基于其实际出勤天数和工作表现。如果员工在月末离职，且当月出勤天数不足一个月，那么药店应当按照其实际出勤天数来计算工资。同时，如果员工在当月有加班、请假等情况，药店也应当根据相关规定进行相应的加减计算。
工资支付方式：药店应当通过银行转账、现金支付等合法方式支付离职员工的工资，并确保支付记录的完整性和可追溯性。如果员工对工资支付有异议，药店应当提供相应的支付记录和计算依据，以便双方进行核对和确认。
特殊情况处理
当然，也存在一些特殊情况可能会影响离职员工工资的支付。比如：
如果员工在离职前存在违反药店规章制度或者劳动合同约定的行为，药店可能会根据相关规定扣除部分工资作为违约金或者赔偿金。但这种情况下的扣除应当合法、合理，并且需要事先与员工进行沟通和确认。
如果员工在离职时存在未结清的借款、预支款等财务问题，药店也应当在支付工资时进行相应的抵扣。但同样需要确保抵扣的合法性和合理性，并且需要事先与员工进行沟通和确认。
建议：如果你在药店月末离职时遇到了工资支付问题，可以先与药店进行协商沟通，了解工资支付的具体情况和原因。如果协商无果或者药店存在违法行为，你可以及时向当地的劳动监察部门投诉或者寻求法律援助。同时，也建议你保留好相关的证据材料，比如劳动合同、工资条、出勤记录等，以便在需要时维护自己的合法权益。