在盗窃案中，当案件移送至检察院后，会经历一系列严谨且规范的司法程序，针对案件中事实清楚与不清楚的部分，检察院会采取不同的处理方式。以下是详细的处理流程及要点：
一、案件受理与初步审查
受理案件：
- 公安机关侦查终结后，会将案件移送检察院审查起诉。检察院在收到案件材料后，会在7日内决定是否受理，对于重大复杂案件，这一期限可延长至3日。若材料不全，检察院会要求公安机关补充侦查。
初步审查：
- 检察院在受理案件后，会进行初步审查，了解案件的基本情况，包括犯罪嫌疑人的身份、涉嫌的犯罪事实、已掌握的证据等。
二、全面审查与补充侦查
全面审查：
- 检察官会全面细致地审查案件，核实犯罪事实是否清楚、证据是否充分、法律适用是否正确，并确认犯罪嫌疑人的身份及诉讼权利保障情况。这一过程中，检察官会特别关注案件中事实清楚与不清楚的部分，对于不清楚的部分，会进行深入调查。
补充侦查：
- 若发现证据不足或事实不清，检察院可以退回公安机关补充侦查，两次为限，每次不超过1个月。在补充侦查过程中，检察院会明确指出需要补充的证据或事实，并要求公安机关在规定时间内完成。
- 检察院也可以自行侦查，必要时要求公安机关协助。这通常发生在检察院认为自行侦查更有利于查清事实的情况下。
三、作出决定
起诉决定：
- 如果经过全面审查和补充侦查后，犯罪事实清楚，证据确实、充分，依法应追究刑事责任，检察院会向法院提起公诉，并移送案卷材料和证据。在起诉书中，检察院会明确指控犯罪事实、罪名及适用法律条款。
不起诉决定：
- 如果证据不足、犯罪情节轻微或依法不应追究刑责，检察院可以作出不起诉决定。这包括法定不起诉（如犯罪已过追诉时效、经特赦令免除刑罚等情形）、酌定不起诉（如犯罪情节轻微，依照刑法规定不需判处刑罚或免除刑罚的情形）和证据不足不起诉（现有证据无法形成完整证明体系，不符合起诉标准）。
四、特殊情况处理
- 对于案件中部分事实清楚、部分事实不清楚的情况，检察院会采取分案处理或部分起诉的方式。即对于事实清楚的部分，依法提起公诉；对于事实不清楚的部分，如果经过补充侦查后仍然无法查清，可能会根据现有证据作出不起诉决定或等待进一步证据后再行处理。
五、犯罪嫌疑人的权利保障
- 在整个处理流程中，检察院会充分保障犯罪嫌疑人的合法权益，如其聘请律师辩护的权利、知情权、辩护权等。检察官会告知犯罪嫌疑人享有的诉讼权利和认罪认罚的法律规定，并听取其意见和辩解。
总结
在盗窃案中，检察院会严格遵守法律程序，对案件进行全面细致的审查。对于事实清楚的部分，依法提起公诉；对于事实不清楚的部分，会进行补充侦查或根据现有证据作出不起诉决定。同时，检察院会充分保障犯罪嫌疑人的合法权益，确保案件处理的公正性、公平性和合法性。