结论：在离婚协议中约定房产一人一半还款，若您目前正在为对方偿还部分款项，在房产出售时，您有权扣除已为对方偿还的部分款项，但具体操作需结合协议内容及实际情况来确定。以下从不同角度为您详细分析：
一、从协议内容角度分析
协议明确约定：
- 如果离婚协议中明确写明了房产一人一半还款，并且详细说明了还款的具体方式、时间节点以及双方的权利义务，那么在房产出售时，您有权按照协议约定扣除已为对方偿还的部分款项。
- 例如，协议中可能规定，每月还款金额中，您承担X元，对方承担Y元，若您实际承担了对方应承担的部分，则在房产出售时，这部分金额应从总房款中扣除并返还给您。
协议未明确约定但存在事实还款：
- 如果协议中没有明确约定还款的具体细节，但您在实际操作中已经为对方偿还了部分款项，并且有相关证据（如转账记录、聊天记录等）证明这一事实，那么在房产出售时，您仍然有权主张扣除这部分款项。
- 在这种情况下，您可能需要通过协商或诉讼等方式来确认您的权益，并确保在房产出售时能够得到相应的补偿。
二、从实际操作角度分析
协商解决：
- 在房产出售前，您可以与对方进行协商，就已为对方偿还的款项达成一致意见，并明确在房产出售时如何扣除这部分款项。
- 协商解决是最快捷、最经济的方式，可以避免不必要的法律纠纷和费用支出。
诉讼解决：
- 如果协商无果，您可以通过诉讼的方式来维护自己的权益。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明您已为对方偿还了部分款项，并请求法院判决在房产出售时扣除这部分款项。
- 诉讼解决可能需要一定的时间和费用支出，但如果您能够提供充分的证据支持自己的主张，那么法院很可能会支持您的诉求。
三、注意事项
保留证据：
- 无论采取哪种方式解决，您都需要保留好相关证据，如转账记录、聊天记录、离婚协议等，以证明您已为对方偿还了部分款项。
了解房产市场情况：
- 在房产出售前，您需要了解当前房产市场的情况，包括房价走势、交易税费等，以便在协商或诉讼过程中能够更准确地计算应扣除的款项金额。
咨询专业律师（此条根据约束条件调整为）：如果您在处理过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。
举例说明：假设您和对方在离婚协议中约定，房产价值200万元，每人承担一半还款，即每人100万元。但在实际操作中，您已经为对方偿还了20万元的款项。那么在房产出售时，您有权主张从总房款中扣除这20万元，即实际应得房款为（200万元-已还贷款总额）/2 + 20万元（您为对方偿还的部分）。当然，具体计算还需根据贷款总额、已还期限等因素来确定。