申请事假公司不批按旷工处理是否合法，需分情况讨论，以下是具体分析：
一、公司规章制度明确且合理的情况
合法性基础：
- 如果公司的规章制度中明确规定了请假的审批流程、条件以及未获批准擅自离岗的后果（如视为旷工），并且这些规定是合法、合理且已向员工公示的，那么公司在员工未获批准的情况下按旷工处理通常是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。规章制度需经民主程序制定并向劳动者公示或告知，内容不得违反法律法规。同时，第三十九条也规定，劳动者严重违反用人单位规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。
合理性考量：
- 规章制度的制定应基于公平、公正的原则，不得侵犯员工的合法权益。例如，请假审批流程应透明、高效，不得无故拖延或拒绝员工的合理请假请求。
- 举例：若公司规定员工请事假需提前三天申请，并经部门负责人批准，且该规定已向员工公示。员工因个人原因未提前申请且未获批准擅自离岗，公司按旷工处理是合法的。
二、公司规章制度不明确或不合理的情况
合法性争议：
- 如果公司的规章制度中没有明确规定请假的审批流程、条件或未获批准擅自离岗的后果，或者这些规定本身存在不合理之处（如过于苛刻、限制员工正常休假权利等），那么公司在员工未获批准的情况下按旷工处理可能构成违法。
- 法律依据：同样依据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，规章制度内容不得与法律法规相抵触，例如不得设定不合理的请假限制。
法律救济途径：
- 在这种情况下，员工有权通过劳动仲裁或诉讼等方式维护自己的合法权益。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》等相关法律法规，员工可以主张公司支付因违法解除劳动合同而产生的赔偿金等。
- 举例：若公司规定员工每年请事假不得超过5天，否则即视为严重违规予以开除。此规定可能因侵犯员工合法权益而被认定为不合法，员工因此被开除的，可以主张赔偿。
三、特殊情况下的处理原则
紧急情况：
- 在紧急情况下（如突发疾病、家庭变故等），员工可能无法及时获得公司的批准而不得不缺勤。此时，公司应根据实际情况灵活处理，避免机械地执行规章制度而导致不公平的结果。
- 举例：员工因直系亲属突发重病需紧急陪同就医，无法提前申请事假。公司应理解并允许员工事后补假，而非直接按旷工处理。
人性化管理：
- 公司应秉持人性化管理理念，关注员工的实际需求和困难，在保障公司正常运转的前提下，尽可能为员工提供便利和支持。
- 建议：公司可以设立紧急请假机制，允许员工在紧急情况下通过电话、短信等方式先行请假，事后补交书面申请。
四、员工应对策略
了解公司规章制度：
- 员工在入职时应仔细阅读并了解公司的规章制度，特别是关于请假和旷工处理的规定。
合理请假并保留证据：
- 员工在请事假时应按照公司规定的流程进行申请，并保留好相关证据（如申请记录、沟通凭证等），以备不时之需。
及时沟通并寻求帮助：
- 若员工因特殊情况无法按时出勤，应及时与公司沟通并说明情况。若公司坚持按旷工处理且员工认为不合理，可以寻求劳动监察部门或律师的帮助。
总结来说，申请事假公司不批按旷工处理是否合法，取决于公司的规章制度是否明确、合理以及员工的具体情况。员工在遇到此类问题时，应了解自己的权益和公司的规定，合理请假并保留证据，及时沟通并寻求帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。