关于物流挂靠公司和老板是否会签协议的问题：
通常会签订协议：在物流行业中，挂靠公司（即实际运营车辆的公司）与车辆老板（即车辆的实际所有者或经营者）之间，为了明确双方的权利和义务，通常会签订挂靠协议。这份协议会详细规定车辆的使用、管理、费用分担、事故责任承担等关键条款。
协议内容的重要性：协议的内容对于双方来说都至关重要，因为它不仅界定了双方的法律关系，还在发生纠纷时作为解决争议的依据。因此，在签订协议时，双方应充分协商，确保协议内容明确、合法、有效。
关于发生交通事故工伤谁赔偿的问题：
这主要取决于事故的具体情况、挂靠协议的内容以及相关法律法规的规定。以下是一些可能的情况和对应的赔偿原则：
如果事故是由车辆老板或其雇佣的驾驶员的过错造成的：
- 工伤赔偿：如果驾驶员在执行工作任务时发生事故，且被认定为工伤，那么根据《工伤保险条例》等相关法律法规，车辆老板（作为用人单位）应承担工伤赔偿责任。
- 第三者责任：如果事故还造成了第三方的损害，车辆老板或驾驶员（如果构成个人侵权）可能还需要承担对第三方的赔偿责任。这部分责任与工伤赔偿是分开的。
如果事故是由挂靠公司的过错造成的（如挂靠公司未提供安全培训、未对车辆进行定期检查等）：
- 挂靠公司可能需承担部分或全部责任：在这种情况下，挂靠公司可能因未履行其管理职责而需对事故造成的损害承担赔偿责任。这包括对驾驶员的工伤赔偿（如果挂靠公司被视为用人单位）以及对第三方的赔偿。
如果事故是由第三方造成的：
- 第三方赔偿：在这种情况下，事故的责任应由第三方承担。驾驶员（或其家属）和车辆老板（或挂靠公司，如果涉及工伤）可以向第三方追偿。
- 工伤赔偿的独立性：即使事故是由第三方造成的，如果驾驶员被认定为工伤，车辆老板（或挂靠公司）仍需按照工伤保险的规定承担工伤赔偿责任。这部分赔偿与对第三方的追偿是分开的。
挂靠协议中的特别约定：
- 协议优先：如果挂靠协议中明确规定了事故责任的承担方式，那么双方应首先按照协议的约定来处理。但需要注意的是，协议中的约定不得违反法律法规的强制性规定，否则该约定可能无效。
建议：
- 签订详细的挂靠协议：为了明确双方的权利和义务，减少纠纷的发生，建议物流挂靠公司与车辆老板在签订挂靠协议时，详细规定事故责任的承担方式、工伤赔偿的处理等关键条款。
- 及时咨询专业律师：在发生交通事故后，双方应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的赔偿途径和金额。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和帮助。
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