后勤人员请假做手术，工资是否会被扣除，主要取决于请假类型及公司规章制度，但通常来说，因病请假做手术不应直接扣除工资。以下从不同角度详细分析：
一、请假类型与工资扣除的关系
病假：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因病或非因工负伤需要停止工作医疗时，企业应根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗期。
- 在医疗期内，企业应按照规定支付员工病假工资或疾病救济费，通常不得低于当地最低工资标准的80%。
- 因此，如果后勤人员因病请假做手术，且处于医疗期内，公司不应直接扣除其工资。
事假：
- 事假通常指员工因个人原因需要请假，如处理私事、参加家庭活动等。
- 对于事假，公司有权根据规章制度决定是否批准，并可能根据请假天数扣除相应工资。
- 但在此案例中，后勤人员是因病请假做手术，不属于事假范畴，因此不应按事假处理并扣除工资。
二、公司规章制度的影响
- 公司规章制度是员工行为准则和公司管理的重要依据。
- 如果公司规章制度中明确规定了病假期间的工资支付标准，且该标准不低于法定要求，那么公司应按照规章制度执行。
- 如果公司规章制度中存在不合理或违法的条款，如无故扣除病假工资，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
三、实际操作建议
后勤人员应提前了解公司规章制度：
- 在请假前，后勤人员应仔细阅读公司规章制度，了解病假期间的工资支付标准。
- 如果对规章制度有疑问或不明确的地方，应及时向人力资源部门或上级领导咨询。
及时提交请假申请和医疗证明：
- 后勤人员应按照公司规定的流程提交请假申请，并附上医疗证明（如医院出具的病假条、诊断证明等）。
- 这有助于证明请假的合理性和必要性，避免公司因缺乏证据而扣除工资。
与公司沟通协商：
- 如果公司因某种原因决定扣除工资，后勤人员应与公司进行沟通协商，了解扣除工资的具体原因和依据。
- 如果认为公司的决定不合理或违法，可以寻求法律援助或向劳动监察部门投诉。
四、法律后果
- 如果公司无故扣除病假工资，可能面临劳动监察部门的处罚和员工的法律诉讼。
- 员工有权要求公司补发被扣除的工资，并可能获得相应的经济补偿或赔偿金。
总结来说，后勤人员请假做手术，如果属于病假范畴且处于医疗期内，公司不应直接扣除其工资。如果公司规章制度中有明确规定且符合法定要求，应按照规章制度执行；如果公司无故扣除工资或规章制度存在不合理条款，员工有权维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。