结论：塔吊证件被挂在别的公司且该公司不配合注销，确实可能影响您的工作，但能否获得赔偿需视具体情况而定。以下从多个角度为您详细分析：
一、证件被挂靠的影响
法律责任风险：若塔吊证件被挂靠的公司利用您的证件进行违法活动或发生安全事故，您作为证件持有人可能面临法律责任，包括行政处罚甚至刑事责任。这将对您的职业生涯和声誉造成严重影响。
工作受限：由于证件被挂靠，您可能无法在其他公司合法使用该证件进行工作，从而限制了您的就业选择和职业发展。
二、能否获得赔偿的分析
挂靠公司的违约责任：
- 如果您与挂靠公司之间存在挂靠协议，且协议中明确规定了挂靠公司应配合注销证件的义务，那么挂靠公司不配合注销的行为构成违约。
- 根据《民法典》的相关规定，违约方应承担违约责任，包括赔偿因违约给对方造成的损失。因此，您有权要求挂靠公司赔偿因证件无法注销而给您造成的经济损失，如误工费、就业机会丧失等。
无挂靠协议的情况：
- 如果您与挂靠公司之间没有签订挂靠协议，或者协议中没有明确规定注销证件的义务，那么情况会相对复杂。
- 在这种情况下，您可能需要通过其他途径来证明挂靠公司的行为给您造成了损失，并且这种损失与挂靠公司的行为之间存在因果关系。这可能需要您收集相关证据，如工作记录、收入证明、与挂靠公司的沟通记录等。
- 如果能够证明上述事实，您仍然有权要求挂靠公司承担一定的赔偿责任，但具体赔偿金额和范围可能需要根据实际情况和法院的判决来确定。
三、建议措施
与挂靠公司协商：
- 首先，您可以尝试与挂靠公司进行协商，要求其配合注销证件。在协商过程中，您可以明确告知挂靠公司其不配合注销的行为可能给您带来的法律责任和工作受限等后果。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（即向我咨询），了解您的具体权益和可行的法律途径。
- 律师可以帮助您分析案情、收集证据、起草法律文书等，为您争取最大的合法权益。
向相关部门投诉：
- 如果挂靠公司的行为涉嫌违法或违规，您还可以向相关部门（如建设行政主管部门、劳动监察部门等）进行投诉或举报。
- 相关部门可能会对挂靠公司进行调查和处理，从而促使挂靠公司配合注销证件。
最后，塔吊证件被挂在别的公司且该公司不配合注销确实可能给您带来诸多不便和损失。但能否获得赔偿需视具体情况而定，包括是否存在挂靠协议、协议中的具体条款以及您能否证明损失与挂靠公司行为之间的因果关系等。因此，建议您根据实际情况采取相应的措施来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。