结论：公司是否因病假两个小时而扣工资，需结合法律规定、公司规章制度及劳动合同的具体内容来判断。一般情况下，公司不应随意扣除病假期间的工资，且病假工资支付标准通常不得低于当地最低工资标准的80%。
详细分析：
法律规定层面：
- 根据劳动法及其实施条例，员工因病或非因工负伤需暂停工作接受医疗时，用人单位应给予一定的医疗期，并支付病假工资或疾病救济费。这是员工的合法权益，公司不得随意剥夺。
- 病假工资的支付标准通常不得低于当地最低工资标准的80%，具体比例由各省、自治区、直辖市人民政府确定。例如，在某些地区，即使员工只请了两小时的病假，公司也应按照相应的比例支付病假工资，而不是直接扣除。
公司规章制度与劳动合同层面：
- 公司可能会根据自身的经营情况和员工管理需要，制定特定的病假政策，如设定特定的病假天数、请假流程等。但这些政策不得违反法律关于病假工资的基本规定。
- 劳动合同中也可能对病假期间的工资待遇进行明确约定。如果劳动合同中有明确规定，且该规定不违反法律法规，那么公司应按照劳动合同的约定执行。
- 举例：假设某公司规章制度规定，员工病假需提前申请，且病假期间工资按照正常工资的80%支付。那么，即使员工只请了两小时的病假，公司也应按照这一比例支付工资，而不是直接扣除。
特殊情况处理：
- 若员工未履行公司关于病假申请的规章制度，如未及时提交病假证明、未按规定的流程请假等，公司可能会根据规章制度进行处理。但这种处理应合理合法，不能违反法律关于病假工资的基本规定。
- 举例：如果员工因突发疾病未能及时提交病假证明，但事后及时补交了相关证明，公司不应因此扣除其病假期间的工资。
员工权益保护：
- 如果公司违反法律规定，在员工病假期间不支付工资或支付的工资低于当地规定的标准，员工有权采取多种措施维护自己的权益。
- 员工可以与公司进行协商，要求公司按照法律规定支付病假工资；协商不成时，可以向劳动监察部门投诉或直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
建议：
- 为确保自身权益得到妥善保护，员工在病假前应详细了解公司的规章制度、劳动合同以及当地的劳动法律法规。
- 如对相关规定有疑问或不明确的地方，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。
综上所述，公司是否因病假两个小时而扣工资并非一概而论，而是需综合考虑法律规定、公司规章制度及劳动合同的具体内容。员工在病假期间应了解自己的权益和义务，并采取适当措施保护自身权益。