结论：邻居在您楼顶上养花是否违法，需根据具体情况判断，主要涉及建筑物区分所有权、相邻关系以及可能存在的物业管理规定等因素。以下从不同角度为您详细分析：

1. 建筑物区分所有权角度

   • 根据《中华人民共和国民法典》中关于建筑物区分所有权的规定，楼顶通常属于建筑物共有部分，由全体业主共同共有。若您作为业主之一，对楼顶享有共有权，那么邻居未经您及其他共有人同意，擅自占用楼顶养花，可能构成对共有权的侵害。
   • 建议：您可先查看购房合同或小区管理规约，确认楼顶的使用权归属。若楼顶确为共有部分，您可与其他共有人协商，要求邻居停止占用或共同决定楼顶的使用方式。

2. 相邻关系角度

   • 相邻关系是指不动产的相邻各方在行使所有权或使用权时，因相互间依法应当给予方便或接受限制而发生的权利义务关系。若邻居在楼顶养花的行为，如浇水、施肥等，对您的生活造成了实质性影响（如噪音、异味、漏水等），则可能违反了相邻关系的处理原则。
   • 建议：您可先与邻居沟通，说明其行为对您造成的影响，并尝试协商解决。若协商无果，您可向物业或社区调解组织寻求帮助，或依法向人民法院提起诉讼，要求邻居停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。

3. 物业管理规定角度

   • 若您所在的小区有物业管理规定，且规定中明确禁止在楼顶等共有部分进行私人种植等活动，那么邻居的行为则违反了物业管理规定。
   • 建议：您可向物业反映情况，要求物业依据管理规定对邻居进行劝阻或制止。若物业未履行管理职责，您可向相关部门投诉或依法提起诉讼，要求物业承担相应的管理责任。

额外提醒：

• 在处理此类纠纷时，建议您先尝试与邻居进行友好沟通，以和平方式解决问题。
• 若沟通无果，您可收集相关证据（如照片、视频、证人证言等），以便在后续协商或诉讼中维护自己的合法权益。
• 鉴于法律问题的复杂性和个体差异性，若您对此类问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。