如果书记员没有把质证意见写进笔录，可以采取以下措施来维护自身权益：

1. 当场提出异议并要求补正：

   • 在庭审或询问等法律程序进行中，一旦发现书记员未记录质证意见，应立即向法庭或相关机构提出异议。
   • 明确指出书记员遗漏了哪些质证意见，并要求其当场进行补正或记录在案。这是最直接且有效的方式，可以确保质证意见被及时、准确地记录下来。

2. 庭后提交书面质证意见作为补充：

   • 如果当场提出异议后，书记员仍未记录或无法当场补正，可以在庭后向法庭提交书面的质证意见。
   • 在书面质证意见中，详细阐述对证据的质证观点和理由，并附上相关证据材料（如有）。同时，可以要求法庭将书面质证意见作为庭审笔录的补充材料，以确保其法律效力。

3. 申请法庭复议或要求重新质证：

   • 如果质证意见的遗漏对案件的审理结果产生了重大影响，可以考虑向法庭申请复议或要求重新进行质证。
   • 在申请复议或重新质证时，需要提供充分的证据和理由，证明书记员未记录质证意见的行为已经影响了案件的公正审理。法庭会根据具体情况决定是否同意复议或重新质证。

4. 保留相关证据以备后续维权：

   • 在整个过程中，务必保留好与质证意见相关的所有证据材料，如庭审录音、录像、书面质证意见等。
   • 这些证据材料在后续的维权过程中将起到至关重要的作用，可以帮助证明书记员未记录质证意见的事实，以及该遗漏对案件审理结果的影响。

额外建议：

• 加强与法庭的沟通：在发现书记员未记录质证意见后，及时与法庭进行沟通，了解法庭对此事的态度和处理方式。通过积极的沟通，可以更好地维护自身权益，并推动案件的公正审理。
• 关注案件审理进度：在采取上述措施的同时，密切关注案件的审理进度和结果。如果发现案件审理结果受到质证意见遗漏的影响，可以及时采取进一步的法律行动来维护自身权益。