短信在立案后仍然可以作为证据使用，但其证据效力需结合具体情况综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、短信作为证据的合法性

根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，证据包括当事人的陈述、书证、物证、视听资料、电子数据等。短信属于电子数据的一种，只要其内容真实、来源合法，且与案件事实相关联，就可以作为证据使用。因此，立案后对方发送的短信，在符合上述条件的情况下，是可以作为证据提交的。

二、短信作为证据的证明力

短信作为证据的证明力，主要取决于其真实性、关联性和合法性。

1. 真实性：短信内容必须真实反映案件事实，不能经过篡改或伪造。如果短信内容存在疑点，或者对方提出异议并能够提供相反证据，那么短信的证明力可能会受到影响。
2. 关联性：短信内容必须与案件事实具有关联性，即能够证明案件中的某个事实或争议点。如果短信内容与案件无关，那么它就不能作为有效证据。
3. 合法性：短信的获取方式必须合法，不能侵犯他人的合法权益。例如，通过非法手段获取的短信（如窃取、偷拍等）是不能作为证据使用的。

三、短信作为证据的提交方式

在立案后，如果你打算将对方发送的短信作为证据提交，需要注意以下几点：

1. 保存原始载体：尽量保存短信的原始载体，如手机、电脑等，以便在需要时能够出示原始证据。
2. 打印或截图：如果无法保存原始载体，可以将短信内容打印出来或截图保存，并注明打印或截图的时间、地点、设备等信息。
3. 公证或认证：为了增强短信的证明力，你可以考虑对短信进行公证或认证。公证或认证可以证明短信的真实性和合法性，提高其在法庭上的可信度。

四、短信作为证据的注意事项

1. 及时收集：在收到对方发送的短信后，应及时收集并保存，避免因为时间过长或设备更换等原因导致短信丢失或无法获取。
2. 完整呈现：在提交短信作为证据时，应确保短信内容的完整性和连续性，避免因为截取或编辑导致短信内容失真或产生歧义。
3. 结合其他证据：短信作为单一证据时，其证明力可能相对较弱。因此，在可能的情况下，应结合其他证据（如聊天记录、转账记录、证人证言等）来共同证明案件事实。

五、特殊情况下的处理

如果对方在立案后发送的短信涉及威胁、侮辱、诽谤等违法行为，或者短信内容与案件事实无关且存在恶意骚扰的情况，你可以及时向法院说明情况，并请求法院对短信的证据效力进行审查。法院会根据具体情况判断短信是否可以作为证据使用，并依法作出处理。

总结来说，立案后对方发送的短信在符合真实性、关联性和合法性的条件下，是可以作为证据使用的。但为了确保短信的证明力，你需要注意保存原始载体、及时收集并完整呈现短信内容，并在可能的情况下结合其他证据来共同证明案件事实。如果你在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。