若第三人善意取得盗赃物后被扣押，可分以下两种情况处理：

1. 若公安机关扣押程序合法且证据充分
   根据《刑法》第六十四条及《刑事诉讼法》相关规定，公安机关对涉案财物有权依法扣押。若公安机关能证明该物品确为盗赃物（如通过原权利人报案记录、物证鉴定、嫌疑人供述等证据链），且扣押程序符合《公安机关办理刑事案件程序规定》中关于涉案财物查封、扣押的要求（如出具扣押清单、通知权利人等），则扣押行为具有合法性。此时，第三人虽主张善意取得，但需通过刑事诉讼中的“赃物追缴程序”主张权利，而非直接对抗扣押行为。

2. 若第三人能证明善意取得且符合法定条件
   根据《民法典》第三百一十二条，善意第三人可主张对盗赃物的所有权，但需满足以下条件：

   • 善意：第三人受让时不知且不应知该物品为盗赃物（如通过正规交易渠道购买、支付合理对价、无重大过失等）；
     
   • 合理价格：转让价格需符合市场行情，显著低于市场价的可能被认定为非善意；
     
   • 已完成交付：动产需完成实际交付，不动产需完成登记。
     

若第三人能提供充分证据（如交易合同、付款凭证、交易场所证明等）证明善意取得，可向扣押机关提出书面异议，并申请解除扣押。若异议被驳回，可在刑事诉讼中作为“案外人”参与诉讼，或单独提起民事诉讼确认所有权，要求返还财物或赔偿损失。

实务建议：

• 立即收集并固定证据（如交易记录、证人证言、物品来源证明等），证明自身善意取得；
  
• 委托律师向扣押机关提交《解除扣押申请书》，明确主张权利的法律依据；
  
• 若扣押机关未依法处理，可向上级机关申请复议，或通过行政诉讼途径维权；
  
• 同步关注刑事案件进展，若原权利人提起刑事附带民事诉讼，需积极应诉并主张善意取得抗辩。
  

风险提示：
若第三人明知或应知物品为盗赃物（如低价收购、来源可疑等），则不构成善意取得，扣押机关可依法没收财物，第三人可能面临行政处罚甚至刑事责任。建议务必核实物品来源，避免参与非法交易。

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程及证据准备要点。