公司被征收五年以上，员工的具体处理方式需根据征收时的相关法律法规、劳动合同约定以及公司实际情况来综合判断。以下是从不同角度给出的详细分析：
一、劳动合同的继续履行与变更
劳动合同的继续履行：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，公司被征收并不必然导致劳动合同的终止。如果征收不影响劳动合同的继续履行，且双方均同意继续履行，那么劳动合同应继续有效，员工应继续在公司工作，享受原有的工资待遇和福利。
劳动合同的变更：
- 如果征收导致公司经营状况发生重大变化，如工作地点、工作内容等发生变更，且这些变更对员工的工作产生实质性影响，那么公司应与员工协商变更劳动合同。协商一致的，可以变更劳动合同的相关内容；协商不成的，公司应按照法律规定支付经济补偿金，并解除劳动合同。
二、经济补偿金的支付
经济补偿金的计算：
- 如果公司因征收而解除与员工的劳动合同，且无法继续履行或变更劳动合同，那么公司应按照《中华人民共和国劳动合同法》的规定支付经济补偿金。经济补偿金的计算通常基于员工在公司的工作年限和月工资水平。具体计算公式为：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（月工资高于公司所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年）。
经济补偿金的支付时间：
- 公司应在解除或终止劳动合同时一次性支付经济补偿金。如果公司未按时支付，员工有权向劳动行政部门投诉，要求公司支付并可能获得额外的赔偿。
三、员工权益的保障
社会保险和住房公积金的转移：
- 公司被征收后，员工的社会保险和住房公积金账户应依法进行转移或接续。公司应协助员工办理相关手续，确保员工的社会保险和住房公积金权益不受影响。
员工安置方案的制定与实施：
- 如果公司因征收而需要进行大规模的员工安置，公司应制定详细的员工安置方案，并报经职工代表大会或全体职工讨论通过。安置方案应包括员工的安置方式、经济补偿、再就业培训等内容，确保员工的合法权益得到充分保障。
四、特殊情况的处理
公司破产或清算：
- 如果公司因征收而陷入破产或清算程序，员工的工资、经济补偿金等债权应依法优先受偿。员工应积极参与破产或清算程序，维护自己的合法权益。
员工与公司之间的争议解决：
- 如果员工与公司之间因征收而产生争议，如经济补偿金的支付、劳动合同的变更等，双方应首先通过协商解决。协商不成的，可以向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
建议：
- 对于员工而言，应密切关注公司的征收进展和安置方案，及时与公司沟通协商，确保自己的合法权益得到保障。
- 如果公司未按照法律规定支付经济补偿金或未履行其他法定义务，员工应及时向劳动行政部门投诉或寻求法律援助。
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