关于城市批次用地能否协议出让的问题，这主要取决于具体的用地性质、规划要求以及相关法律法规的规定。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，协议出让国有土地使用权是受到严格法律规范的。根据《協議出讓國有土地使用權規定》，协议出让国有土地使用权是指国家以协议方式将国有土地使用权在一定年限内出让给土地使用者，并由土地使用者向国家支付土地使用权出让金的行为。然而，这种出让方式并非适用于所有情况。
一、协议出让的适用条件
非经营性用地：根据规定，同一地块上只有一个意向用地者，且该地块并非用于商业、旅游、娱乐和商品住宅等经营性用途时，市、县人民政府国土资源行政主管部门方可采取协议方式出让。这意味着，对于城市批次用地中的非经营性部分，如公共设施、基础设施等，是有可能通过协议出让的。
符合规划要求：协议出让的土地必须符合土地利用总体规划、城市规划和土地市场状况。因此，在考虑协议出让时，必须确保用地符合相关规划要求。
二、协议出让的限制
经营性用地除外：对于商业、旅游、娱乐和商品住宅等经营性用地，即使只有一个意向用地者，也不能采取协议方式出让，而应通过招标、拍卖或挂牌等公开竞争方式出让。
最低价限制：协议出让国有土地使用权的出让金不得低于按国家规定所确定的最低价。这一规定旨在防止土地资源的低价出让和浪费。
三、实际操作流程
编制出让计划：市、县人民政府国土资源行政主管部门应根据经济社会发展计划、国家产业政策等编制国有土地使用权出让计划，并报同级人民政府批准后组织实施。
接受意向用地申请：在出让计划公布后，需要使用土地的单位和个人可以根据出让计划提出意向用地申请。
制订协议出让土地方案：对符合协议出让条件的，市、县人民政府国土资源行政主管部门会同城市规划等有关部门制订协议出让土地方案。
确定协议出让底价：根据国家产业政策和拟出让地块的情况，对拟出让地块的土地价格进行评估，并合理确定协议出让底价。
签订出让合同：在协商一致且议定的出让价格不低于出让底价的情况下，市、县人民政府国土资源行政主管部门与意向用地者签订《国有土地使用权出让合同》。
四、特殊情况
对于城市批次用地中的特殊部分，如高科技项目、市政公共设施项目以及国家机关、部队、文教、卫生、体育、科研单位的非营利性建设项目用地，可能享受地价减免等优惠政策，并通过协议出让或行政划拨方式取得土地使用权。但这种情况需要严格遵循相关法律法规和政策规定，并经过严格的审批程序。
综上所述，城市批次用地能否协议出让取决于具体的用地性质、规划要求以及相关法律法规的规定。在实际操作中，必须严格遵循相关法律法规和政策规定，确保土地资源的合理利用和保护。如果您有具体的用地需求或疑问，建议咨询当地国土资源行政主管部门或专业律师以获取更准确的解答。